More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10309 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  100 
 
 
302 aa  614  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
294 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.99 
 
 
320 aa  146  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0924  Protochlorophyllide reductase  40.46 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
299 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000241123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  32.71 
 
 
325 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  30.5 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  30.82 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  34.56 
 
 
330 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  31.46 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  32.54 
 
 
433 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  30.96 
 
 
320 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  30.96 
 
 
320 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
298 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07926  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.686054  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
287 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
312 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
303 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  30.82 
 
 
320 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  37.22 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  29.7 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 
311 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
306 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
306 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  29.97 
 
 
321 aa  109  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  34.64 
 
 
302 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.44 
 
 
316 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
297 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 
299 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 
308 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
312 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  31.48 
 
 
320 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
317 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
320 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  32.8 
 
 
292 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  35.54 
 
 
363 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  35.54 
 
 
363 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
317 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
305 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  28.14 
 
 
338 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.1 
 
 
333 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  26.47 
 
 
337 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
307 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  29.38 
 
 
300 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  26.47 
 
 
337 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  33.54 
 
 
303 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
325 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  29.6 
 
 
328 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.25 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
307 aa  99  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
316 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  29.64 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  25.99 
 
 
333 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.07 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  31.63 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.23 
 
 
326 aa  95.5  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  31.58 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  27.44 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
290 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  27.24 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  24.65 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  29.81 
 
 
318 aa  92.4  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  30.56 
 
 
316 aa  92.4  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
286 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
281 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
284 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  31.41 
 
 
300 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>