More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_4180 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  100 
 
 
328 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  45.12 
 
 
329 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  46.71 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  44.07 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  42.99 
 
 
325 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  44.11 
 
 
323 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  42.55 
 
 
320 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  42.55 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  44.55 
 
 
321 aa  259  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  43.29 
 
 
320 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  42.42 
 
 
328 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  44.37 
 
 
545 aa  239  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  38.18 
 
 
318 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  36.55 
 
 
337 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  36.26 
 
 
337 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  38.48 
 
 
316 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  38.62 
 
 
338 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  36.09 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  34.02 
 
 
334 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  33.14 
 
 
334 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  34.21 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  33.43 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  32.17 
 
 
302 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  31.96 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.44 
 
 
340 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.35 
 
 
348 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.67 
 
 
340 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.24 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  27.98 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.17 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.92 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  30.98 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  29.2 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.77 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.47 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  37.93 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  37.93 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  31.54 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  30 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  33.67 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.79 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  31.13 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  32.2 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.84 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  30.77 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  36.62 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  34.48 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
269 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  32.88 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  27.65 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.6 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  35.42 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  26.25 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  35.46 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  28.73 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  34.72 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  26.76 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>