More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0740 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  100 
 
 
316 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  85.67 
 
 
318 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  70.09 
 
 
337 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  69.79 
 
 
337 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  68.81 
 
 
334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  70.61 
 
 
321 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  67.07 
 
 
338 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  61.02 
 
 
329 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  61.46 
 
 
323 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  62.82 
 
 
328 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  57.01 
 
 
334 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  56.19 
 
 
334 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  56.4 
 
 
334 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  54.24 
 
 
334 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  57.51 
 
 
325 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  57.64 
 
 
321 aa  355  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  58.92 
 
 
320 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  58.92 
 
 
320 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  58.79 
 
 
320 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  45.32 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  38.92 
 
 
328 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  35.31 
 
 
545 aa  202  8e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  33.13 
 
 
330 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.61 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.7 
 
 
340 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  32.3 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.22 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
298 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  32.31 
 
 
322 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.34 
 
 
333 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  31.35 
 
 
292 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
306 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.87 
 
 
333 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.71 
 
 
326 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  30.56 
 
 
302 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.7 
 
 
333 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  31.27 
 
 
301 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.79 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
324 aa  99.4  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.96 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 
299 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.48 
 
 
298 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.31 
 
 
335 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  33.5 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.36 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  29.43 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  30.67 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.48 
 
 
328 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  27.61 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  29.71 
 
 
306 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
327 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.1 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  28.48 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.48 
 
 
329 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  28.48 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
279 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.97 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  28.21 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  28.98 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  27.88 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  32.76 
 
 
206 aa  84  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.66 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.33 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.48 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>