More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0542 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  100 
 
 
334 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  93.11 
 
 
334 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  92.49 
 
 
334 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  84.73 
 
 
334 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  58.23 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  58.23 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  59.17 
 
 
338 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  55.46 
 
 
334 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  57.01 
 
 
316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  55.32 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  51.5 
 
 
321 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  49.55 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  47.62 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  47.4 
 
 
328 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  45.81 
 
 
325 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  46.15 
 
 
321 aa  291  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  47.6 
 
 
320 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  47.4 
 
 
320 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  47.4 
 
 
320 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  37.85 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  39.4 
 
 
545 aa  202  9e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  34.31 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.15 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.47 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.12 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  31.1 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
287 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  28.53 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  30.8 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  24.85 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28.92 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.26 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.57 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.56 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  31.82 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.25 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
269 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.36 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  28.81 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  25 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  25.94 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.24 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  25 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  25 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  26.05 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.69 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.96 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  25.68 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  25.68 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.58 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.84 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.09 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.61 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  25.7 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.94 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  33.87 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  29.43 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  23.99 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.18 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  26.04 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  25.77 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.52 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  37.4 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  27.41 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.36 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  24.85 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.5 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.62 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.23 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.47 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  27.17 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  26.83 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.63 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.02 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.09 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32314  predicted protein  27.52 
 
 
388 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  25.3 
 
 
661 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  24.9 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>