More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1998 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  100 
 
 		 320 aa  670    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  76.8 
 
 		 329 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  72.41 
 
 		 325 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  70.72 
 
 		 321 aa  491  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  74.45 
 
 		 320 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  74.14 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  67.18 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  66.36 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  58.28 
 
 		 318 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  54.57 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  54.57 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  53.58 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  58.79 
 
 		 316 aa  339  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  53.7 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  54.41 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  49.1 
 
 		 433 aa  319  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  47.76 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  47.6 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  46.87 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  46.71 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  43.29 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  42.36 
 
 		 545 aa  240  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  35.61 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  34.97 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.64 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.97 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  30.7 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  30.82 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  37.31 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  31.23 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.11 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  31.23 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  29.69 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  29.71 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.27 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.58 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.73 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  27.74 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.53 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.97 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.01 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.48 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.53 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.09 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  36.36 
 
 		 206 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 341 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  34.12 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 		 303 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  28.23 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.66 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  30.59 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.13 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.88 
 
 		 335 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  31.13 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  31.13 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  26.65 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  27.81 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.92 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  33.73 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  33.6 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.44 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0924  Protochlorophyllide reductase  30.75 
 
 		 301 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.67 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 281 aa  92.4  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>