More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06901 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  100 
 
 
333 aa  655    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  93.69 
 
 
333 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  85.29 
 
 
333 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  68.77 
 
 
333 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  39.08 
 
 
348 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  41.56 
 
 
340 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  41.56 
 
 
340 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  37.42 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  44.62 
 
 
335 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  35.91 
 
 
322 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  33.23 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  29.57 
 
 
321 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  28.75 
 
 
329 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  29.97 
 
 
323 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  28.66 
 
 
320 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  28.83 
 
 
325 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  28.66 
 
 
320 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  29.31 
 
 
318 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  26.25 
 
 
302 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  26.81 
 
 
320 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  28.7 
 
 
316 aa  95.9  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  27.79 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  32.68 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  27.16 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.15 
 
 
287 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  36.89 
 
 
309 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  33.78 
 
 
300 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  27.22 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  34.63 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.99 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  27.22 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.15 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.58 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.46 
 
 
304 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  23.62 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  33.17 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  26.25 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  32.16 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  26.67 
 
 
311 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  28.48 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  24.32 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  22.77 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.4 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.13 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.31 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  26.79 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.72 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  22.15 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  29.15 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.13 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.64 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.84 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  22.96 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.66 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  22.19 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  22.19 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  22.19 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  24.24 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.43 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  24.24 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  28.84 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  24.24 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.39 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.03 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  28.46 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.53 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  29.28 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.03 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.05 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.54 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.53 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  23.03 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  25.56 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  23.04 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05270  AY086643 putativepod-specific dehydrogenase SAC25, putative  30.45 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.83 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.82 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  25.84 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  23.94 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  25.56 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  27.38 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  22.71 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  28.07 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.31 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10494  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.19 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  22.5 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>