More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0352 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
294 aa  603  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  35.59 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
324 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  35.29 
 
 
330 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  34.68 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  34.34 
 
 
308 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
298 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 
300 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 
300 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
326 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 
304 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
317 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 
311 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  31.53 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  30.03 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  33.56 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
297 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  29.91 
 
 
325 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  28.75 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0494  hypothetical protein  81.43 
 
 
70 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
287 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
306 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
289 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
306 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
289 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
289 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  31.86 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 
306 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  31.1 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
306 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
317 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  28.62 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
312 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0924  Protochlorophyllide reductase  32.11 
 
 
301 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  38.21 
 
 
363 aa  108  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  38.21 
 
 
363 aa  108  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  31.31 
 
 
303 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  36.59 
 
 
302 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  32.88 
 
 
299 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
322 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
303 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
289 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
312 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  29.97 
 
 
320 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 
301 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  31.23 
 
 
292 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
298 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
303 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  30.12 
 
 
320 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
316 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  30.12 
 
 
320 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  29.9 
 
 
320 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  39.22 
 
 
298 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
314 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  27.63 
 
 
320 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  32.78 
 
 
309 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
301 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  35.96 
 
 
206 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 
305 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  32.53 
 
 
309 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
269 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
304 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.5 
 
 
328 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
349 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  37.5 
 
 
329 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.5 
 
 
329 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  29.94 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  27.18 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  37.5 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  34.95 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  32.01 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  30.51 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  30.22 
 
 
324 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
320 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.26 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07926  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.686054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>