More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0109 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  100 
 
 
323 aa  670    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  74.3 
 
 
321 aa  508  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  73.29 
 
 
329 aa  504  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  70.5 
 
 
325 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  72.67 
 
 
321 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  68.42 
 
 
320 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  68.42 
 
 
320 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  67.18 
 
 
320 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  57.14 
 
 
328 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  59.68 
 
 
318 aa  371  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  61.46 
 
 
316 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  58.05 
 
 
337 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  57.75 
 
 
337 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  56.75 
 
 
334 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  56.36 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  48.09 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  49.4 
 
 
334 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  49.55 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  49.4 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  47.65 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  43.79 
 
 
545 aa  250  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  44.11 
 
 
328 aa  248  8e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  37.84 
 
 
330 aa  162  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  33.93 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  31.02 
 
 
340 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  31.46 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  30.42 
 
 
340 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  30.36 
 
 
348 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  31.56 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  32.51 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.09 
 
 
333 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
312 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
300 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 
300 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 
300 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.97 
 
 
333 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
294 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  30.58 
 
 
333 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.84 
 
 
301 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
298 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  30.46 
 
 
316 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 
298 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.61 
 
 
333 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  30 
 
 
304 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  35.2 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
298 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 
303 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  26.97 
 
 
300 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
319 aa  93.2  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 
305 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  33.91 
 
 
206 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.33 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  27.5 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
302 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.49 
 
 
335 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  29.11 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 
301 aa  89.7  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.93 
 
 
292 aa  89  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  26.71 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.86 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.13 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  27.19 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  31.86 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
298 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  31.86 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.03 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
312 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  32.24 
 
 
268 aa  86.3  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.39 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  32.41 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  27.41 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  31.84 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  28.4 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.41 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  31.84 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0924  Protochlorophyllide reductase  31.33 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.99 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.65 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.33 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>