More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07921 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  100 
 
 
334 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  71.81 
 
 
337 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  71.81 
 
 
337 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  74.04 
 
 
338 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  69.21 
 
 
318 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  68.2 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  62.42 
 
 
321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  56.8 
 
 
334 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  56.12 
 
 
334 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  57.19 
 
 
334 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  57.06 
 
 
334 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  57.67 
 
 
323 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  55.76 
 
 
329 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  56.06 
 
 
321 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  54.41 
 
 
325 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  52.78 
 
 
328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  54.94 
 
 
320 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  53.23 
 
 
320 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  53.23 
 
 
320 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  41.81 
 
 
433 aa  266  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  39.12 
 
 
545 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  34.32 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  29.7 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  30.09 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  32.05 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.24 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  31.83 
 
 
328 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.99 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.95 
 
 
340 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  36.36 
 
 
298 aa  102  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.72 
 
 
298 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.46 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  29.7 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  27.49 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  30.79 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.66 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 
300 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
304 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  29.23 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.57 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.04 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  26.89 
 
 
303 aa  89  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
301 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.36 
 
 
326 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  30.36 
 
 
322 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.33 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.45 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.94 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28.44 
 
 
272 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.18 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  27.98 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  26.2 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  27.76 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  27.63 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  29.74 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  29.74 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  26.06 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  26.06 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  31.69 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  29.29 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  28.45 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  27.43 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.53 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  28.03 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  28.24 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>