More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13231 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  100 
 
 
348 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  47.98 
 
 
340 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  47.66 
 
 
340 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  47.9 
 
 
328 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  48.36 
 
 
322 aa  285  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  49.54 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  40.31 
 
 
333 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  39.69 
 
 
333 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  39.08 
 
 
333 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  38.46 
 
 
333 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  38.58 
 
 
330 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  33.03 
 
 
321 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  31.2 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  44.5 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  29.5 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  31.21 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  30.95 
 
 
320 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  30.95 
 
 
320 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  30.36 
 
 
323 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  30.7 
 
 
320 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  30.09 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  28.7 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  28.12 
 
 
334 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  29.38 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  27.92 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
310 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  27.75 
 
 
334 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
301 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  30.14 
 
 
318 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  28.41 
 
 
337 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  28.41 
 
 
337 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  28.99 
 
 
338 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
324 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
287 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  29.22 
 
 
316 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  33.63 
 
 
311 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
288 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  26.93 
 
 
433 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.94 
 
 
309 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  30.04 
 
 
309 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  31.36 
 
 
309 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  28.53 
 
 
316 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  27.84 
 
 
329 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.84 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  27.84 
 
 
333 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  28.95 
 
 
309 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
298 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.27 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.19 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  31.19 
 
 
301 aa  96.7  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
306 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
322 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
306 aa  95.9  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
312 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  32.58 
 
 
318 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  28.05 
 
 
306 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.61 
 
 
326 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  33.48 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  29.86 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  28.79 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
305 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  29.28 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  28.99 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  28.99 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.88 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 
307 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  30.61 
 
 
302 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.58 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
303 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  28.06 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.64 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  29.6 
 
 
300 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
303 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  28.74 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
290 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  33.33 
 
 
329 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 
324 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  29.33 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  28.52 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>