More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1216 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  100 
 
 
322 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  61.01 
 
 
328 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  48.06 
 
 
348 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  44.92 
 
 
340 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  44.92 
 
 
340 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  47.52 
 
 
335 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  40.12 
 
 
333 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  37 
 
 
333 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  35.91 
 
 
333 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  34.88 
 
 
333 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  37.69 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  32.72 
 
 
321 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  31.53 
 
 
329 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  43.3 
 
 
298 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  31.56 
 
 
323 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  31.6 
 
 
325 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  32.82 
 
 
328 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  31.45 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  31.45 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  30.33 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  31.23 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  31.88 
 
 
337 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  31.67 
 
 
337 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
287 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  32.82 
 
 
318 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  28.7 
 
 
433 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  32.31 
 
 
316 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  32.43 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  32.43 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  35 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  31.32 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  30.8 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  27.13 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  31.6 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  34 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  29.49 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  26.81 
 
 
309 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  30.57 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.08 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  34.85 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  31.16 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  31.87 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  30.36 
 
 
334 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 
307 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  27.81 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  29.54 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.66 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  28.17 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32314  predicted protein  29.19 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  27.52 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  30.54 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  28.48 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  28.48 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.48 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  26.43 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.71 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.55 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.79 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0384845  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  29.15 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7223  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.22 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  34.17 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.4 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2020  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.95 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.45 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  26.75 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  26.75 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  26.75 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>