More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06611 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  100 
 
 
333 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  93.69 
 
 
333 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  85.29 
 
 
333 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  70.27 
 
 
333 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  39.69 
 
 
348 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  42.63 
 
 
340 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  42.63 
 
 
340 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  37.73 
 
 
328 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  45.4 
 
 
335 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  37 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  34.13 
 
 
330 aa  161  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  29.57 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  28.23 
 
 
329 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  30.58 
 
 
323 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  26.92 
 
 
320 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  28.27 
 
 
320 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  28.27 
 
 
320 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  27.69 
 
 
325 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.99 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  28.48 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  28.87 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  25.99 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.78 
 
 
298 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 
297 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  28.1 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.21 
 
 
324 aa  89.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  25.46 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  31.22 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  34.05 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  27.51 
 
 
337 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.84 
 
 
305 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.84 
 
 
304 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  27.51 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  24.32 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  34.93 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
292 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  29.18 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  23.84 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  33.17 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  27.3 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  26.57 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  33.17 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  24.55 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
303 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  24.55 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.84 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  29.33 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  31.74 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  24.62 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  24.62 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.62 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  26.25 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  28.79 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  24.55 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.6 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.67 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.72 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.89 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.92 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.46 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  23.96 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.68 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.14 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.78 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.48 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  24.4 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.78 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  22.42 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  29.28 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.6 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.75 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.84 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  29.96 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.78 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  24.77 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  30.42 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.44 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  24.22 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  26.73 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  29.28 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.53 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  24.55 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.66 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.33 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  23.91 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  23.91 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  24.9 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  27.8 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>