More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07421 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_07421  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  100 
 
 
335 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.784304  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  49.54 
 
 
348 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  51.38 
 
 
340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  51.38 
 
 
340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  46.91 
 
 
328 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  47.52 
 
 
322 aa  288  8e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  46.93 
 
 
333 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  44.62 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  45.4 
 
 
333 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  44.17 
 
 
333 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  34.62 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  31.91 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  32.04 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  32.04 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  30.3 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  39.35 
 
 
298 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  30.33 
 
 
321 aa  125  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  31.21 
 
 
321 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  30.91 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  29.61 
 
 
323 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
287 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  30.12 
 
 
316 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  28.88 
 
 
320 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  28.01 
 
 
328 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  30.4 
 
 
311 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  30.79 
 
 
334 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  29.65 
 
 
334 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  25.95 
 
 
302 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  28.74 
 
 
337 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  28.74 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  30.55 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  30.33 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  31.11 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
305 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  28.2 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  28.57 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  30.23 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
310 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.67 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  29.78 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  31.74 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.59 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 
292 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  27.43 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  24.64 
 
 
433 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  28.57 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
307 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 
288 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  29.82 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  29.82 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  24.92 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.28 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  28.25 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28.44 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.23 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.39 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  25.55 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.75 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.85 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  23.71 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.69 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  23.81 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.17 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.07 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  23.78 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.79 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.15 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.35 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.15 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  26.82 
 
 
302 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  24.12 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  26.47 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  26.22 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  24.01 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  23.05 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  26.75 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
294 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.23 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  26.75 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  24.01 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.41 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>