More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
320 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
299 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000241123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  37.99 
 
 
302 aa  146  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0924  Protochlorophyllide reductase  35.58 
 
 
301 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.63 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  34.49 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07926  conserved hypothetical protein  30.72 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.686054  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  27.96 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  29.75 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  29.75 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  29.69 
 
 
598 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  27.16 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  31.21 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  28.53 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  27.27 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00521  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.22713  decreased coverage  0.00776745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.69 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07799  Uncharacterized oxidoreductase AN7799 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AV81]  26.64 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.97 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.53 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  31.1 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.55 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  30.31 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  28.53 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
273 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  26.33 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.207273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  23.66 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.06 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
298 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  25.34 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  23.66 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
320 aa  62.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  26.88 
 
 
334 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.04 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0634  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  23.49 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  31.67 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.16 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  30.49 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  30.18 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  30.49 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
248 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  28.08 
 
 
433 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  23.69 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04373  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 
417 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.208641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  33.03 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  25.87 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  22.4 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
271 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>