More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29212 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_29212  predicted protein  100 
 
 
317 aa  661    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401861  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26050  predicted protein  43.37 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00210  serine/threonine kinase receptor associated protein, putative  40.12 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00228942  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07705  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08320)  38.79 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.56 
 
 
1363 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 
1163 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49739  predicted protein  25.75 
 
 
323 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0845252 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39526  predicted protein  27.33 
 
 
337 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.2 
 
 
696 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.83 
 
 
930 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.36 
 
 
1552 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90188  Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit (eIF3 p39) (Translation initiation factor eIF3, p39 subunit)  25.8 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0117416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.84 
 
 
1652 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.96 
 
 
1357 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.87 
 
 
947 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.83 
 
 
1831 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.5 
 
 
1364 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.5 
 
 
1236 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.08 
 
 
1760 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.59 
 
 
1510 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.8 
 
 
1229 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.88 
 
 
1481 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.08 
 
 
742 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.41 
 
 
778 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  27.76 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.57 
 
 
1553 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02997  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I (eIF3i)(Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit homolog)(eIF-3 39 kDa subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y3]  26.19 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322368  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.61 
 
 
576 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.59 
 
 
1523 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.18 
 
 
1823 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.78 
 
 
1686 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.74 
 
 
1477 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 
1213 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.58 
 
 
1242 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.15 
 
 
774 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.61 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.37 
 
 
1196 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.01 
 
 
1474 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.97 
 
 
1858 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  24 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.77 
 
 
1221 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.01 
 
 
1217 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.15 
 
 
1262 aa  82.8  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  26.24 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.05 
 
 
1348 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  26.77 
 
 
589 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.44 
 
 
1247 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 
1190 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 
1208 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.46 
 
 
1304 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 
1161 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.17 
 
 
1188 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.3 
 
 
1807 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.94 
 
 
664 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.08 
 
 
1454 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.48 
 
 
1789 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.85 
 
 
1193 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 
1367 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.94 
 
 
1211 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.71 
 
 
677 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.21 
 
 
1240 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
1190 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.42 
 
 
1609 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.81 
 
 
596 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05850  conserved hypothetical protein  23.65 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.25 
 
 
1491 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.32 
 
 
622 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.28 
 
 
1868 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.51 
 
 
1267 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.84 
 
 
630 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.42 
 
 
1607 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.85 
 
 
1411 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.3 
 
 
1557 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.39 
 
 
1599 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.28 
 
 
1901 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.16 
 
 
924 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.08 
 
 
1856 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.04 
 
 
1583 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.51 
 
 
642 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.74 
 
 
682 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.07 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.3 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.47 
 
 
740 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.56 
 
 
1711 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.47 
 
 
618 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.31 
 
 
919 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00081  G-protein beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74214]  22.48 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.54 
 
 
1209 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.84 
 
 
505 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 
1016 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.41 
 
 
1164 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  25 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.3 
 
 
1004 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.03 
 
 
1617 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.77 
 
 
1443 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.56 
 
 
1039 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  24.06 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1344 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>