More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05850 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA05850  conserved hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  704    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02997  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I (eIF3i)(Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit homolog)(eIF-3 39 kDa subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y3]  55.89 
 
 
336 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322368  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90188  Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit (eIF3 p39) (Translation initiation factor eIF3, p39 subunit)  50 
 
 
350 aa  354  1e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0117416 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49739  predicted protein  47.71 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0845252 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39526  predicted protein  42.49 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.44 
 
 
1357 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.84 
 
 
1221 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.63 
 
 
696 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.93 
 
 
1474 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.69 
 
 
1229 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.77 
 
 
1523 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26050  predicted protein  25.55 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.12 
 
 
1213 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.08 
 
 
1364 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.96 
 
 
1247 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 
1481 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.62 
 
 
1454 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.79 
 
 
676 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.06 
 
 
1831 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.32 
 
 
1217 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.64 
 
 
740 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.87 
 
 
1330 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00210  serine/threonine kinase receptor associated protein, putative  27.68 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00228942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.45 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.38 
 
 
1188 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 
947 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.68 
 
 
596 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.07 
 
 
1363 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.27 
 
 
1652 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.69 
 
 
1193 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.87 
 
 
1599 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 
1236 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.82 
 
 
1163 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.26 
 
 
1868 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
677 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.61 
 
 
1242 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  25.29 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.36 
 
 
464 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.87 
 
 
1510 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.27 
 
 
1807 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.99 
 
 
630 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.22 
 
 
1553 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 
1211 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.48 
 
 
742 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
1311 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.12 
 
 
1901 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.43 
 
 
576 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25 
 
 
1262 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.78 
 
 
930 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.22 
 
 
1443 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 
1878 aa  79.3  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.31 
 
 
1856 aa  79.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.9 
 
 
924 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.5 
 
 
728 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  23.24 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29212  predicted protein  23.65 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.45 
 
 
1188 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.29 
 
 
657 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 
1240 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.22 
 
 
1196 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  27.93 
 
 
872 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.92 
 
 
1557 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  26.95 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.88 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  22.26 
 
 
778 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  24.58 
 
 
1280 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 
1367 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1214 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  21.98 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  26.38 
 
 
840 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  22.57 
 
 
774 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07705  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08320)  24.34 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  24.4 
 
 
1416 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.88 
 
 
1190 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  20.68 
 
 
1552 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  22.09 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  25.6 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 
780 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.73 
 
 
1477 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.82 
 
 
1205 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.83 
 
 
1656 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.49 
 
 
664 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.1 
 
 
1760 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.14 
 
 
1583 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  31.91 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.38 
 
 
1161 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.28 
 
 
1208 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  21.91 
 
 
1661 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.48 
 
 
1711 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.01 
 
 
675 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  25.1 
 
 
1209 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.38 
 
 
1161 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  22.43 
 
 
608 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.64 
 
 
1267 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 
1164 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  22.18 
 
 
589 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>