286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39526 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39526  predicted protein  100 
 
 
337 aa  699    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49739  predicted protein  45.4 
 
 
323 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0845252 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02997  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I (eIF3i)(Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit homolog)(eIF-3 39 kDa subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y3]  43.28 
 
 
336 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322368  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05850  conserved hypothetical protein  42.49 
 
 
341 aa  262  4.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90188  Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit (eIF3 p39) (Translation initiation factor eIF3, p39 subunit)  40.36 
 
 
350 aa  257  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0117416 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29212  predicted protein  27.33 
 
 
317 aa  102  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401861  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26050  predicted protein  27.27 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.813084 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.43 
 
 
1364 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 
1474 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00210  serine/threonine kinase receptor associated protein, putative  28.09 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00228942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
1831 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.14 
 
 
1443 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 
577 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.98 
 
 
740 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 
1510 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  24.89 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 
1481 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07705  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08320)  26.39 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24 
 
 
1652 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.31 
 
 
1416 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.08 
 
 
1004 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  22.88 
 
 
696 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.15 
 
 
1599 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.63 
 
 
1901 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  25.49 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.44 
 
 
1262 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1552 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.27 
 
 
1163 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.06 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.5 
 
 
1553 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.6 
 
 
1623 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1196 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 
1878 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 
1164 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.9 
 
 
1213 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.59 
 
 
1363 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.33 
 
 
1193 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.24 
 
 
1188 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.83 
 
 
1229 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.9 
 
 
1221 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
1190 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.19 
 
 
1868 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.61 
 
 
924 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.57 
 
 
676 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.64 
 
 
1236 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.59 
 
 
1161 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  36.11 
 
 
782 aa  69.3  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.69 
 
 
1686 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  25.46 
 
 
872 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.04 
 
 
1626 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  25 
 
 
790 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.11 
 
 
1454 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.98 
 
 
1211 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.18 
 
 
1217 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.11 
 
 
1547 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.69 
 
 
1161 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  24.44 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.97 
 
 
1823 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 
1760 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.83 
 
 
947 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  22.71 
 
 
434 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.54 
 
 
1684 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 
1711 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.59 
 
 
1523 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  26.34 
 
 
452 aa  66.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.81 
 
 
1807 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.83 
 
 
1247 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.45 
 
 
1607 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  21.99 
 
 
1367 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.01 
 
 
630 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  24.2 
 
 
840 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  23.61 
 
 
1304 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.94 
 
 
1856 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.31 
 
 
742 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.31 
 
 
1214 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.02 
 
 
1188 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 
1789 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  20.73 
 
 
778 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  24.45 
 
 
516 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.09 
 
 
576 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.73 
 
 
1583 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.7 
 
 
1357 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34219  predicted protein  23.2 
 
 
364 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.11 
 
 
589 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  23.81 
 
 
522 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  37 
 
 
1177 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  20.96 
 
 
1311 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  26.39 
 
 
780 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.27 
 
 
1609 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 
1176 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  21.69 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  24.11 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.36 
 
 
692 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08017  catabolite degradation protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02400)  24.81 
 
 
827 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0053965 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  25 
 
 
418 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.44 
 
 
1714 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>