More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00210 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00210  serine/threonine kinase receptor associated protein, putative  100 
 
 
367 aa  751    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00228942  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07705  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08320)  45.75 
 
 
340 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26050  predicted protein  41.06 
 
 
299 aa  236  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29212  predicted protein  40.12 
 
 
317 aa  223  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401861  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49739  predicted protein  31 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0845252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.7 
 
 
1363 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 
1163 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.62 
 
 
1236 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 
947 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.48 
 
 
316 aa  92.8  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 
1552 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 
1481 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  29.3 
 
 
316 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.51 
 
 
1760 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 
1510 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05850  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39526  predicted protein  28.09 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90188  Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit (eIF3 p39) (Translation initiation factor eIF3, p39 subunit)  25 
 
 
350 aa  87  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0117416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 
1474 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.97 
 
 
1557 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 
1553 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.86 
 
 
1221 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  29.39 
 
 
1367 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 
1072 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.26 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.73 
 
 
1686 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28 
 
 
1242 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 
1072 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.57 
 
 
1868 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.9 
 
 
1188 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.71 
 
 
919 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.62 
 
 
1229 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.31 
 
 
1267 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.17 
 
 
1076 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.57 
 
 
622 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 
696 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.15 
 
 
1609 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.43 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.27 
 
 
1547 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.12 
 
 
1684 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 
1240 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.02 
 
 
677 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  27.52 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.32 
 
 
1247 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.52 
 
 
1357 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02997  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I (eIF3i)(Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit homolog)(eIF-3 39 kDa subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y3]  25.74 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322368  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.82 
 
 
742 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.53 
 
 
1348 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.13 
 
 
1617 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.19 
 
 
1607 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.56 
 
 
1196 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.13 
 
 
1364 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.81 
 
 
930 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 
1211 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.67 
 
 
1652 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.76 
 
 
1443 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  24.64 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.74 
 
 
682 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.5 
 
 
1398 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1164 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 
778 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.18 
 
 
1599 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.65 
 
 
1193 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 
1858 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.14 
 
 
618 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  26.49 
 
 
1330 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.53 
 
 
1831 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.46 
 
 
564 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 
1477 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.71 
 
 
1454 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.59 
 
 
790 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.65 
 
 
1161 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.65 
 
 
1161 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.27 
 
 
1217 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.42 
 
 
1262 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.78 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.47 
 
 
1626 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.68 
 
 
1523 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.11 
 
 
1190 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.05 
 
 
740 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 
1213 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.57 
 
 
664 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  25.47 
 
 
589 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.58 
 
 
657 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.81 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.46 
 
 
1901 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.59 
 
 
924 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.63 
 
 
1491 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.24 
 
 
692 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  28.23 
 
 
1100 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 
1208 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.31 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.92 
 
 
1598 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  27.74 
 
 
1280 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  27.02 
 
 
540 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.9 
 
 
1188 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.56 
 
 
792 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>