175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11356 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11356  predicted protein  100 
 
 
51 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  66.67 
 
 
495 aa  84.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  64.71 
 
 
1326 aa  82.8  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16262  predicted protein  66.67 
 
 
479 aa  80.9  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  70.59 
 
 
663 aa  79.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  61.22 
 
 
1517 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  56 
 
 
1222 aa  65.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  62 
 
 
522 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  56 
 
 
589 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  54 
 
 
860 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  53.06 
 
 
970 aa  63.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  54 
 
 
1111 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  54.9 
 
 
1023 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  55.1 
 
 
1407 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  52 
 
 
1096 aa  61.6  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  57.14 
 
 
868 aa  61.6  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01070  transcription regulator, putative  54.9 
 
 
1519 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  53.06 
 
 
1431 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  53.06 
 
 
1259 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  53.06 
 
 
1558 aa  60.1  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  53.06 
 
 
926 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  53.06 
 
 
1566 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  50.98 
 
 
1414 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  53.33 
 
 
1053 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  48 
 
 
995 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  48.98 
 
 
956 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12368  predicted protein  54.17 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138069  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  48 
 
 
1107 aa  57.4  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  53.33 
 
 
1698 aa  57  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  51.11 
 
 
1557 aa  57  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  54.17 
 
 
609 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  49.02 
 
 
1269 aa  54.7  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  51.22 
 
 
1067 aa  53.9  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  51.11 
 
 
1246 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  52.5 
 
 
1904 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  45.83 
 
 
993 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  51.22 
 
 
1193 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  43.14 
 
 
1769 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  44.9 
 
 
1093 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  52.63 
 
 
1901 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  45.83 
 
 
1011 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  48.89 
 
 
1765 aa  51.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  44.44 
 
 
509 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  46 
 
 
898 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  47.92 
 
 
821 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  51.06 
 
 
821 aa  50.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  48.89 
 
 
1612 aa  50.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  48 
 
 
1142 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  46 
 
 
621 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  43.75 
 
 
711 aa  50.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  41.18 
 
 
1848 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  55 
 
 
688 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  43.9 
 
 
1016 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  43.48 
 
 
902 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  44.9 
 
 
983 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51604  predicted protein  46 
 
 
509 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  44.68 
 
 
1081 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  45.1 
 
 
535 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  43.9 
 
 
809 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  48.89 
 
 
975 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  47.92 
 
 
833 aa  47.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  44.9 
 
 
832 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  44.68 
 
 
1181 aa  47.4  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
1160 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  50 
 
 
1118 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  46 
 
 
1120 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  43.75 
 
 
818 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  42 
 
 
1086 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  46 
 
 
1120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  47.73 
 
 
1068 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.74 
 
 
1227 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 
1155 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 
1112 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 
933 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  40.82 
 
 
939 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  43.59 
 
 
988 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  46.81 
 
 
1386 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  40.91 
 
 
1154 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  46.81 
 
 
1362 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  44 
 
 
1164 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 
1152 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
1066 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  46.67 
 
 
648 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  43.14 
 
 
545 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.43 
 
 
1150 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  43.59 
 
 
1025 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  42 
 
 
1126 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  40 
 
 
903 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  46.81 
 
 
1021 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  45.45 
 
 
777 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01650  DNA dependent ATPase, putative  40.91 
 
 
1036 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.03 
 
 
1031 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.55 
 
 
1143 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  46.81 
 
 
1120 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  38.64 
 
 
1032 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  42.55 
 
 
1209 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  43.18 
 
 
1163 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
1403 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  47.73 
 
 
991 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  51.35 
 
 
1354 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>