More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3571 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3571  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 701 aa  1391    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.226926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  34.91 
 
 		 462 aa  183  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  32.17 
 
 		 471 aa  180  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3867  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.3 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  33.89 
 
 		 458 aa  172  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  33.82 
 
 		 473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  32.12 
 
 		 476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.77 
 
 		 475 aa  167  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  32.94 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  28.79 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  31.67 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  37.5 
 
 		 385 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.58 
 
 		 502 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  32.7 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  33.42 
 
 		 457 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  31.26 
 
 		 472 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  31.81 
 
 		 456 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  34.46 
 
 		 502 aa  164  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  35.03 
 
 		 525 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  30.53 
 
 		 471 aa  163  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  33.33 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  33.33 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  31.63 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  33.51 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  32.74 
 
 		 480 aa  162  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  33.33 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  33.25 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  32.3 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  33.25 
 
 		 474 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  32.67 
 
 		 513 aa  161  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  32.21 
 
 		 477 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  31.23 
 
 		 466 aa  161  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  31.51 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  32.47 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  31.07 
 
 		 485 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  32.2 
 
 		 464 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.54 
 
 		 408 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  33.65 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  31.38 
 
 		 457 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  31.38 
 
 		 463 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  31.38 
 
 		 457 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  33.51 
 
 		 477 aa  157  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  33.51 
 
 		 477 aa  157  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  31.13 
 
 		 506 aa  157  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  33.86 
 
 		 475 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  33.86 
 
 		 475 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  33.86 
 
 		 475 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  33.86 
 
 		 478 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  33.86 
 
 		 478 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  33.51 
 
 		 504 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  33.16 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  33.16 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  32.28 
 
 		 479 aa  156  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  33.16 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  32.71 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  33.25 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  33.16 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  33.16 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  33.16 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  32.76 
 
 		 476 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  31.71 
 
 		 500 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  33.07 
 
 		 474 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  31.99 
 
 		 476 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  29.64 
 
 		 455 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.36 
 
 		 511 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  32.77 
 
 		 476 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  33.33 
 
 		 487 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  30.37 
 
 		 451 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  33.42 
 
 		 496 aa  154  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  29.64 
 
 		 482 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  30.37 
 
 		 455 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  30.37 
 
 		 455 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  30.37 
 
 		 455 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  35.74 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  33.42 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  34.84 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  32.73 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  35.05 
 
 		 383 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  33.33 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  34.57 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  34.6 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  33.25 
 
 		 506 aa  152  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  31.5 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  31.5 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  30.68 
 
 		 498 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  31.5 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  30.68 
 
 		 498 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  30.68 
 
 		 498 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.47 
 
 		 479 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  33.08 
 
 		 485 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  36.39 
 
 		 498 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  33.51 
 
 		 488 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  33.58 
 
 		 498 aa  151  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  34.55 
 
 		 511 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  33.95 
 
 		 511 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  34.09 
 
 		 524 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  31.5 
 
 		 502 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  30.04 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  29.4 
 
 		 471 aa  151  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>