107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3751 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3751  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 
702 aa  1367    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  29.38 
 
 
958 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1657  hypothetical protein  36.32 
 
 
513 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.755126 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 
1185 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.26 
 
 
828 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 
1262 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
1088 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
776 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.25 
 
 
1050 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
857 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.29 
 
 
801 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  23.13 
 
 
1125 aa  87.4  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
1105 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
953 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
785 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.65 
 
 
1146 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  26 
 
 
1311 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  22.48 
 
 
1131 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.13 
 
 
1288 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  26.18 
 
 
845 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  28.29 
 
 
847 aa  75.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  25.62 
 
 
1509 aa  74.7  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.44 
 
 
1488 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  21.28 
 
 
1039 aa  71.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.07 
 
 
1314 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.13 
 
 
1128 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.42 
 
 
675 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 
911 aa  68.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.17 
 
 
1068 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.59 
 
 
793 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
924 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.97 
 
 
822 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  26.93 
 
 
713 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 
1424 aa  63.9  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 
671 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.98 
 
 
1328 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  22.88 
 
 
1136 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  25.76 
 
 
1056 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  24.25 
 
 
1500 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
568 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 
568 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
966 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 
849 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
652 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.49 
 
 
672 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.32 
 
 
1324 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  28 
 
 
304 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
284 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 
577 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  22.59 
 
 
1523 aa  58.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
454 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 
767 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  28.42 
 
 
838 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
640 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  25.94 
 
 
829 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  24.92 
 
 
934 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 
919 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  26.53 
 
 
916 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
481 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1658  Tetratricopeptide TPR_4  25.72 
 
 
405 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856151  normal  0.917391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
444 aa  55.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  30.23 
 
 
392 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 
771 aa  55.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  28.81 
 
 
897 aa  55.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
837 aa  54.7  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
843 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  28.34 
 
 
963 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.19 
 
 
1212 aa  54.3  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  28.76 
 
 
1261 aa  54.3  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  26.25 
 
 
843 aa  54.3  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  25.68 
 
 
457 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  25.68 
 
 
918 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
1283 aa  53.9  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  25.12 
 
 
311 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  24.76 
 
 
1010 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
1290 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  21.64 
 
 
551 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
751 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.3 
 
 
841 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 
854 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 
991 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.65 
 
 
1309 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
814 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  24.87 
 
 
702 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  30.17 
 
 
900 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 
885 aa  48.5  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  27.52 
 
 
362 aa  48.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  28.66 
 
 
212 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
787 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  26.14 
 
 
731 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  23.32 
 
 
680 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.59 
 
 
1475 aa  47.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.32 
 
 
708 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
526 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  30.61 
 
 
1076 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 
1049 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
469 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  27.04 
 
 
1383 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.74 
 
 
1186 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>