273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0311 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0311  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.62 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 		 734 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.17 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 721 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 676 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.46 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  33.5 
 
 		 440 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.5 
 
 		 443 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  31.16 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.86 
 
 		 567 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  30.19 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  30.19 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  32 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  32 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  30.22 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.28 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.56 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.67 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.3 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30.17 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  27.31 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  38.64 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  31.32 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  29.21 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  29.02 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  31.47 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.22 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  25.61 
 
 		 440 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  32.41 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  26.21 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.67 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.66 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.33 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.99 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  35 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.67 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.82 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  37.72 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.67 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  24.6 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.73 
 
 		 669 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.97 
 
 		 434 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  30.56 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  33.13 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 430 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  26.4 
 
 		 450 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  26.22 
 
 		 461 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31 
 
 		 429 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.5 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  32.43 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  33.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.33 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  32.84 
 
 		 1005 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  32.43 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.06 
 
 		 437 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  30.33 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  28.07 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  31.66 
 
 		 439 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  32.39 
 
 		 1097 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.09 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.17 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  28.21 
 
 		 454 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.03 
 
 		 427 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  35.14 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  29.92 
 
 		 1040 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  34.59 
 
 		 1066 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.52 
 
 		 444 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 646 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  30.83 
 
 		 450 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  40.43 
 
 		 944 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  26.07 
 
 		 439 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  28 
 
 		 443 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.9 
 
 		 445 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  31.94 
 
 		 1069 aa  52.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.89 
 
 		 667 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  30.08 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1111 aa  52.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.17 
 
 		 442 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  28.18 
 
 		 469 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  34.23 
 
 		 509 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 450 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.69 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  28.82 
 
 		 427 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  36.92 
 
 		 497 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.3 
 
 		 441 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  29.51 
 
 		 1042 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  24.91 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 441 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  28.5 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.37 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  29.45 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.59 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>