More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1771 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1771  response regulator receiver protein  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.48 
 
 		 953 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.86 
 
 		 802 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.74 
 
 		 1677 aa  142  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.76 
 
 		 836 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  48.39 
 
 		 757 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  49.25 
 
 		 803 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.23 
 
 		 812 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 763 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2092  response regulator receiver protein  50.81 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  51.75 
 
 		 356 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 		 929 aa  130  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 		 1134 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.18 
 
 		 691 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 976 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  47.62 
 
 		 635 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 		 482 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1400  response regulator receiver protein  54.63 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0005153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.41 
 
 		 769 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2810  response regulator receiver protein  54.63 
 
 		 137 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0831229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1004 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 		 1004 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2154  response regulator receiver protein  42.54 
 
 		 361 aa  118  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  45.9 
 
 		 1177 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 		 748 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  47.2 
 
 		 1452 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 		 785 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2744  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000111314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.36 
 
 		 709 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0969  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.954662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0911  response regulator receiver protein  49.53 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.41 
 
 		 777 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2879  response regulator receiver domain-containing protein  42.28 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 819 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 901 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 869 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 1184 aa  91.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 1184 aa  91.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1415  response regulator  40.32 
 
 		 131 aa  90.9  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 860 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 1023 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 869 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 522 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 886 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 822 aa  87.8  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 1023 aa  87.8  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 886 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 914 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1040 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 829 aa  84.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 871 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 522 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  33.6 
 
 		 882 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.9 
 
 		 890 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1193 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 841 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 802 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 997 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 814 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 758 aa  77  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 810 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 997 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 759 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1419 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2443  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 657 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 1016 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1418 aa  70.9  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 973 aa  70.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 803 aa  70.5  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 703 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1122 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 682 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 619 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 857 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 714 aa  67.8  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 540 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 559 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 893 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 846 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 738 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 882 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1021 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 		 417 aa  65.1  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 531 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2439  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0297  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 711 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.219152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 817 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 630 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 556 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 692 aa  63.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  27.15 
 
 		 866 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.7 
 
 		 916 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 654 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>