More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2744 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2744  response regulator receiver protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000111314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1400  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0005153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2810  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0831229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1771  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0911  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.87 
 
 		 802 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 763 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 		 836 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 1677 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 785 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  46.3 
 
 		 803 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2092  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 812 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 929 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  40.31 
 
 		 757 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1415  response regulator  39.1 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  38.93 
 
 		 1452 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 		 953 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1134 aa  94.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  38.33 
 
 		 356 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 769 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 709 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  39.29 
 
 		 1177 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2879  response regulator receiver domain-containing protein  40.57 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 748 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 691 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1004 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 482 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1004 aa  84.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 901 aa  84.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0969  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.954662  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 976 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  34.15 
 
 		 635 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2154  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 361 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 819 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.68 
 
 		 777 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 522 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1184 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1023 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1023 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 738 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 522 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 1184 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 973 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 860 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 914 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1040 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 886 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 882 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 829 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  31.75 
 
 		 844 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 886 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 997 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 802 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 559 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 869 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 871 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 803 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 869 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.67 
 
 		 860 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4405  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.851623  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  27.69 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0751  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.56 
 
 		 490 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 682 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.33 
 
 		 890 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5345  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.37 
 
 		 455 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 810 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 997 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.23 
 
 		 453 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 822 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0477  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 443 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1641  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 183 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.772734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.6 
 
 		 470 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 727 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2505  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 		 707 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 727 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 841 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  32.71 
 
 		 468 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 1622 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1269  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.74 
 
 		 705 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.56 
 
 		 472 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.58 
 
 		 721 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  27.69 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3261  response regulator receiver  31.82 
 
 		 295 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 999 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 		 923 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 657 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 923 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 923 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 923 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  34.88 
 
 		 472 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 893 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 		 619 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>