More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1454 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1454  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
927 aa  85.5  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.52 
 
 
623 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 
1694 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.44 
 
 
810 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
4079 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 
818 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
1276 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  26.53 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 
1056 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
955 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
467 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
878 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 
784 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
3035 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
523 aa  68.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
565 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.18 
 
 
730 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
1276 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.78 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.65 
 
 
1138 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.1 
 
 
462 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.36 
 
 
1979 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 
564 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
711 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.47 
 
 
1056 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 
1022 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  26.47 
 
 
545 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
352 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 
1297 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
740 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.73 
 
 
573 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
361 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
1406 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.94 
 
 
725 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.98 
 
 
397 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
363 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
373 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  22.81 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.12 
 
 
784 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
333 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1049 aa  62.4  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.55 
 
 
626 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
1069 aa  62  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
614 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
614 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.42 
 
 
988 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
827 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 
689 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
1121 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.84 
 
 
620 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  26.87 
 
 
1067 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 
2240 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 
1421 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
331 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
602 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  20.43 
 
 
371 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 
626 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.74 
 
 
560 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 
632 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 
635 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
366 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
614 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.21 
 
 
545 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 
547 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 
614 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 
614 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  22.41 
 
 
706 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
935 aa  59.3  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
716 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 
329 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
2262 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  28.8 
 
 
452 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  21.69 
 
 
745 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  26.76 
 
 
668 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 
626 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2046  tetratricopeptide protein  32.58 
 
 
315 aa  58.9  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000249019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  26.35 
 
 
390 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
620 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 
1192 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  28.04 
 
 
714 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.62 
 
 
715 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 
1013 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.4 
 
 
1056 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
342 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
699 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  31.3 
 
 
135 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 
836 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
1737 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>