More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0723 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0723  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
345 aa  704    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0862368  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2060  tetratricopeptide TPR_2  53.62 
 
 
984 aa  346  4e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0749  TPR repeat-containing protein  43.52 
 
 
991 aa  288  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.903349  normal  0.875303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 
213 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 
1694 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
1094 aa  79.7  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
743 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
1276 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
716 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.9 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.56 
 
 
706 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
927 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  35.17 
 
 
573 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
711 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
4489 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
3035 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.17 
 
 
462 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.03 
 
 
582 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
602 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
732 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
3560 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.62 
 
 
1007 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
543 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
1979 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
699 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
244 aa  62.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.07 
 
 
623 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  28.89 
 
 
539 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.5 
 
 
706 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 
648 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.94 
 
 
745 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 
632 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.03 
 
 
730 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
562 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
713 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
452 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 
810 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
626 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
1069 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 
626 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
162 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 
626 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  31.54 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 
614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.07 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.15 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 
614 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.22 
 
 
715 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
523 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.49 
 
 
739 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
512 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.65 
 
 
560 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.09 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
1827 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 
1106 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.01 
 
 
1022 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
4079 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 
784 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
635 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.39 
 
 
707 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
1276 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
605 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
635 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
611 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
265 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.77 
 
 
739 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
619 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.3 
 
 
742 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.57 
 
 
865 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
217 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
1486 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
331 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.34 
 
 
581 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
598 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
878 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
836 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
636 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
637 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  28.39 
 
 
519 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 
466 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 
135 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
3172 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>