More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0749 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0749  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
991 aa  2037    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.903349  normal  0.875303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2060  tetratricopeptide TPR_2  43.03 
 
 
984 aa  768    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0722  hypothetical protein  38.54 
 
 
616 aa  429  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952426  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0723  TPR repeat-containing protein  43.52 
 
 
345 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0862368  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.76 
 
 
1694 aa  81.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
4489 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
713 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
523 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.76 
 
 
1979 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 
1276 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
1094 aa  70.1  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
927 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
4079 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.39 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.05 
 
 
267 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  32.28 
 
 
745 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
711 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
250 aa  65.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25 
 
 
706 aa  65.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  25 
 
 
582 aa  65.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
213 aa  65.1  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 
632 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.32 
 
 
397 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.65 
 
 
730 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.62 
 
 
743 aa  64.7  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
543 aa  64.7  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
878 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.41 
 
 
462 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
352 aa  64.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
217 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.78 
 
 
742 aa  64.3  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 
810 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.54 
 
 
706 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.33 
 
 
560 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
602 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
3560 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
581 aa  61.6  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 
1069 aa  61.6  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.75 
 
 
573 aa  61.6  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
3035 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.78 
 
 
707 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.08 
 
 
739 aa  60.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
244 aa  59.7  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
747 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.78 
 
 
623 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
265 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
306 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
1486 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.52 
 
 
1007 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 
626 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
221 aa  59.7  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
522 aa  59.3  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 
1022 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
649 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.3 
 
 
2240 aa  58.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
406 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
406 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.21 
 
 
314 aa  58.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
576 aa  57.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
1827 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
3145 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.55 
 
 
581 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
667 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 
530 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 
566 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 
626 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 
614 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
614 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
344 aa  57  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
392 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
329 aa  57  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 
626 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  24.87 
 
 
715 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
614 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
542 aa  57  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  30.7 
 
 
387 aa  56.6  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 
648 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 
614 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
717 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
750 aa  56.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  30.2 
 
 
645 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
371 aa  55.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  29.2 
 
 
530 aa  55.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
687 aa  55.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
269 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
732 aa  55.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
617 aa  55.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  25 
 
 
539 aa  55.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
363 aa  55.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
450 aa  55.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
213 aa  54.7  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.25 
 
 
740 aa  54.7  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.84 
 
 
887 aa  54.7  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
717 aa  54.7  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 
645 aa  54.7  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
1737 aa  54.7  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
639 aa  54.7  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
611 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
202 aa  53.9  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.19 
 
 
820 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>