168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1492 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1492  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 447 aa  886    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.226993  hitchhiker  0.000066146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0386  FAD dependent oxidoreductase  67.27 
 
 		 451 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0302403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2306  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  32.17 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  32.51 
 
 		 523 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  29.76 
 
 		 512 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  29.76 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  29.98 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  30.48 
 
 		 519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  33.06 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  30.72 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  30.2 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  32.86 
 
 		 499 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  32.34 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  30.13 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  28.96 
 
 		 518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  32.02 
 
 		 515 aa  130  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  30.82 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.51 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  30.2 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  31.13 
 
 		 511 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  31.18 
 
 		 512 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  25.29 
 
 		 502 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  25.29 
 
 		 502 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  30.04 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  30.43 
 
 		 519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  29.98 
 
 		 503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  31.11 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  31.71 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  29.11 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  31.03 
 
 		 495 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.15 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  32.57 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  28.69 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0266  methoxyneurosporene dehydrogenase  32.36 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.37 
 
 		 508 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  25.48 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  25.48 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  32.03 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  27.2 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  21.02 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.96 
 
 		 493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.53 
 
 		 504 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  29.33 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.52 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  23.06 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  27.27 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  28.2 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  27.73 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.42 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.89 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  29.08 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 511 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  28.89 
 
 		 508 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25.2 
 
 		 537 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.61 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  28.93 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  29.08 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  29.08 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  24.9 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  29.02 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  29.61 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  28.39 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  26.86 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  28.63 
 
 		 506 aa  99.8  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  26.67 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  25.16 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.71 
 
 		 519 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  30.53 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  27.25 
 
 		 492 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.24 
 
 		 509 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  30.99 
 
 		 520 aa  96.7  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  30.97 
 
 		 502 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  25.41 
 
 		 553 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  28.69 
 
 		 524 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  28.22 
 
 		 498 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  30.46 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.64 
 
 		 492 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  29.58 
 
 		 492 aa  93.2  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.96 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  27.51 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  27.16 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  25.21 
 
 		 490 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  20.43 
 
 		 511 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  26.58 
 
 		 507 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  31.67 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  25.68 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  25.92 
 
 		 553 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 501 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  27.65 
 
 		 495 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  25.79 
 
 		 552 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  29.83 
 
 		 494 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  26.79 
 
 		 530 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  27.2 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  25.23 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>