185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0386 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0386  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 451 aa  885    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0302403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1492  FAD dependent oxidoreductase  67.27 
 
 		 447 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.226993  hitchhiker  0.000066146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2306  FAD dependent oxidoreductase  53.43 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  35.01 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  32.71 
 
 		 523 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  33.7 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  33.05 
 
 		 511 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  32.16 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  30.17 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  32.39 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  30.71 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  29.72 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  29.92 
 
 		 512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  29.72 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  32.39 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  32.27 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  32.77 
 
 		 502 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  27.4 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  32.02 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  28.24 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  29.73 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  27.66 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  32.58 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  32.3 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  32.06 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  30.52 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  32.38 
 
 		 495 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  29.52 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  29.81 
 
 		 515 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  32.61 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  33.68 
 
 		 495 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  26.79 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  26.79 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  30.56 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  27.33 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  32.26 
 
 		 500 aa  116  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  30.77 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.99 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  27.71 
 
 		 531 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  28.83 
 
 		 519 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.91 
 
 		 511 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0266  methoxyneurosporene dehydrogenase  31.78 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  27.04 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  24.06 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  24.06 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  25.83 
 
 		 497 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  28.78 
 
 		 504 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.91 
 
 		 511 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  24.53 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  27.27 
 
 		 519 aa  107  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  29.65 
 
 		 495 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.91 
 
 		 509 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  28.6 
 
 		 503 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  28.02 
 
 		 497 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  28.42 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  31.34 
 
 		 502 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  29.61 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.54 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  27.69 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  29.29 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.79 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  26.14 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  29.44 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  27.9 
 
 		 525 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  29.47 
 
 		 506 aa  99.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  24.46 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  27.33 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  31.15 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  29.16 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  29.16 
 
 		 512 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  22.63 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  29.16 
 
 		 512 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  28 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  23.48 
 
 		 488 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.68 
 
 		 553 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  29.57 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  26.57 
 
 		 490 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  31.37 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  28.16 
 
 		 504 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.88 
 
 		 518 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.48 
 
 		 493 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  28.16 
 
 		 506 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 501 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  27.83 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  31.91 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  33.09 
 
 		 492 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.06 
 
 		 492 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  27.41 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  26.24 
 
 		 518 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  26.24 
 
 		 518 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  29.54 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.73 
 
 		 507 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  25.73 
 
 		 549 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.91 
 
 		 508 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  29.32 
 
 		 508 aa  87  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  25.2 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>