196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2306 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2306  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 494 aa  973    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0386  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0302403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1492  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.226993  hitchhiker  0.000066146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  32.22 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 524 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  31.77 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 516 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  33.4 
 
 		 532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 495 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  34.56 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  35.43 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  33.19 
 
 		 499 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  31.15 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  33.48 
 
 		 499 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  34.66 
 
 		 500 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  32.9 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  32.08 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  23.22 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  30.55 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  29.08 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  31.71 
 
 		 503 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  25.71 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  25.71 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  33.26 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.27 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  28.6 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  32.27 
 
 		 499 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  28.84 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  32.61 
 
 		 495 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  29.64 
 
 		 504 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  30.11 
 
 		 509 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  36.81 
 
 		 452 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  30.79 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  28.77 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  28.4 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25.7 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  32.2 
 
 		 496 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.18 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  27.18 
 
 		 497 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  27.98 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  27.42 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.13 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  26.21 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  28.46 
 
 		 507 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.33 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  27.74 
 
 		 497 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  26.95 
 
 		 518 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.25 
 
 		 493 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  23.15 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  23.15 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  28.57 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  28.33 
 
 		 509 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  31.06 
 
 		 520 aa  97.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  29.71 
 
 		 506 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  28.72 
 
 		 512 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  28.72 
 
 		 512 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.9 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  26.62 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.26 
 
 		 511 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  28.72 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  27.24 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  24 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  32.02 
 
 		 507 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.28 
 
 		 509 aa  94  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  30.69 
 
 		 502 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  24.59 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.82 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  23.66 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.3 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  27.81 
 
 		 507 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  28.57 
 
 		 492 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  26.69 
 
 		 498 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.84 
 
 		 511 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.8 
 
 		 504 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  29.75 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  24.45 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.35 
 
 		 511 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  26.98 
 
 		 525 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.04 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.3 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  28.31 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  29.32 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  25.16 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  28.99 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  28.21 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0266  methoxyneurosporene dehydrogenase  29.63 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  29.61 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.23 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  22.52 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  25.96 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.41 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  27.02 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  28.6 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  28.81 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  27.06 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  25.5 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  26.79 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  24.59 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  24.22 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>