More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0317 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  73.1 
 
 		 154 aa  223  9e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  74.83 
 
 		 148 aa  217  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  61.64 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  60.87 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  50.35 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  41.67 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  41.96 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  42.66 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  39.16 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  38.46 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  39.16 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  38.41 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  44.85 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  37.59 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  37.06 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  37.14 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  44.44 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  39.86 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  40.43 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  36.99 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  36.36 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  33.94 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  36.96 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  34.75 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  36.96 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  36.23 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  37.59 
 
 		 173 aa  87.4  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  30.71 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  32.39 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.69 
 
 		 393 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  36.56 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  36.36 
 
 		 572 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  36.08 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  35.35 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  32.81 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  31.31 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  32.98 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  33.98 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.11 
 
 		 365 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  36.56 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  30.51 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  36.36 
 
 		 441 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  33.67 
 
 		 493 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 538 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  33.67 
 
 		 369 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  32.67 
 
 		 412 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  30.89 
 
 		 537 aa  53.5  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  32.67 
 
 		 412 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 337 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  28.57 
 
 		 333 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  33.65 
 
 		 471 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  34.48 
 
 		 495 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  32.32 
 
 		 552 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 488 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  34.04 
 
 		 381 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 442 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  31.9 
 
 		 516 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  34.34 
 
 		 442 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  37.76 
 
 		 322 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  31.91 
 
 		 405 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  32.98 
 
 		 442 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 383 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  32.32 
 
 		 535 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  31.82 
 
 		 524 aa  51.6  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  32.32 
 
 		 533 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3061  transcription elongation factor NusA  30.89 
 
 		 499 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000291489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  34.78 
 
 		 385 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 368 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  28.23 
 
 		 497 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  32.53 
 
 		 341 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  29.53 
 
 		 493 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0632  transcription termination factor NusA  31.71 
 
 		 495 aa  50.4  0.000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  29.53 
 
 		 493 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  31.07 
 
 		 382 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 407 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2828  transcription elongation factor NusA  30.89 
 
 		 499 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00193559  hitchhiker  0.00416619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  28.19 
 
 		 348 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  29.06 
 
 		 366 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  33.67 
 
 		 484 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  34.12 
 
 		 355 aa  50.1  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  34.75 
 
 		 380 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 425 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  34.41 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  36.17 
 
 		 406 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  30.23 
 
 		 492 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  31.91 
 
 		 538 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 382 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  29.06 
 
 		 366 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 498 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 425 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  31.31 
 
 		 493 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  31.31 
 
 		 493 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  31.31 
 
 		 475 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 384 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>