More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2164 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  100 
 
 		 148 aa  298  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  74.83 
 
 		 149 aa  233  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  74.83 
 
 		 149 aa  233  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  74.15 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  64.38 
 
 		 157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  57.14 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  47.55 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  44.76 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  44.06 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  54.1 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  41.43 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  43.36 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  44.06 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  42.66 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  41.96 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  38.73 
 
 		 148 aa  116  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  40.14 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  39.42 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  51.61 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  49.6 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  39.57 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  45.19 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  40.14 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  45 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  40.15 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  42.65 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  35.37 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  39.86 
 
 		 173 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  40.58 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  39.13 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  39.86 
 
 		 173 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  34.29 
 
 		 184 aa  90.5  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  33.09 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  31.43 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  38.78 
 
 		 441 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  40.22 
 
 		 329 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  36.46 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  38.14 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  38.14 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  37.11 
 
 		 484 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  37.11 
 
 		 471 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  39.13 
 
 		 337 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 467 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  36.73 
 
 		 442 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  36.73 
 
 		 442 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  35.58 
 
 		 347 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  34.91 
 
 		 382 aa  60.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  36.54 
 
 		 369 aa  60.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 373 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  35.92 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  39.13 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  34.45 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  35.92 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  36.84 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  35.48 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  36.46 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  37.11 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  37.23 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  35.71 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 425 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  36.56 
 
 		 485 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  36.63 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 423 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  34.19 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  35.79 
 
 		 467 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 333 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  35.79 
 
 		 481 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 405 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 378 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  34.78 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 362 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  36.08 
 
 		 354 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  36.96 
 
 		 347 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  38.04 
 
 		 337 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  36.96 
 
 		 347 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 348 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  35.48 
 
 		 421 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  36.96 
 
 		 347 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  32.11 
 
 		 368 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 467 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 344 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  32.99 
 
 		 404 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 365 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  35.48 
 
 		 393 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  33.03 
 
 		 366 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  38.04 
 
 		 333 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  32.99 
 
 		 401 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  32.11 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  36.96 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  36.59 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  33.67 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  36.96 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  34.19 
 
 		 354 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3061  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 499 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000291489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  32.11 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  31.62 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>