229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0282 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  47.45 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  45.99 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  45.99 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  45.99 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  43.54 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  42.65 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  45.59 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  34.53 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  34.53 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  34.06 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  35.77 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  33.33 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  30.71 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  30.71 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  32.48 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  36.21 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  33.09 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  31.39 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  35.04 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  33.1 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  31.21 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  30.56 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  33.04 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  32.77 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  31.54 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  30.53 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  28.99 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  26.28 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  27.54 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  28.26 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  27.54 
 
 		 173 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  43.37 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  40.96 
 
 		 402 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  39.76 
 
 		 405 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  37.36 
 
 		 442 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  37.36 
 
 		 442 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  37.5 
 
 		 360 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  36.96 
 
 		 444 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  39.76 
 
 		 503 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  35.42 
 
 		 493 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  35.48 
 
 		 381 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 380 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 365 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  38.55 
 
 		 516 aa  50.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  36.14 
 
 		 395 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  35.71 
 
 		 358 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 382 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  32.19 
 
 		 520 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  35.16 
 
 		 442 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 361 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 482 aa  48.9  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  30.21 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  33.75 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  31.53 
 
 		 330 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  36.46 
 
 		 322 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  37.35 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  37.35 
 
 		 407 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 545 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  36.25 
 
 		 362 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 544 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  37.35 
 
 		 545 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  32.93 
 
 		 423 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  33.75 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  36.14 
 
 		 344 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 560 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  30.95 
 
 		 418 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 536 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 545 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 524 aa  47.8  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  36.47 
 
 		 523 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 373 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 411 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 385 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  36.14 
 
 		 532 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  36.14 
 
 		 538 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.78 
 
 		 536 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  37.35 
 
 		 556 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  33.75 
 
 		 344 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  36.14 
 
 		 548 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  37.35 
 
 		 391 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  37.35 
 
 		 391 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  35.29 
 
 		 362 aa  47  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  34.94 
 
 		 365 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  32.99 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  33.73 
 
 		 326 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  30.91 
 
 		 485 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  34.94 
 
 		 351 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  32.99 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  33.73 
 
 		 374 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  31.58 
 
 		 473 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  38.1 
 
 		 449 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  31.82 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  31.25 
 
 		 414 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  30.91 
 
 		 484 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  31.19 
 
 		 471 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 413 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  33.73 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>