154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0103 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 139 aa  276  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  56.74 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  55.17 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  46.39 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  53.9 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  42.65 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  42.34 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  37.23 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  37.14 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  37.14 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  38.85 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  40 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  39.57 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  37.86 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  37.14 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  38.57 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  34.31 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  36.17 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  35.51 
 
 		 148 aa  95.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  35.77 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  32.61 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  36.69 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  36.15 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  32.85 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  31.06 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  35.2 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  33.07 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  31.01 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  31.43 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  37.36 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  37.36 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  22.22 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  30.5 
 
 		 374 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 337 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  36.73 
 
 		 354 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  39.56 
 
 		 365 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  36.26 
 
 		 357 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  36.26 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 341 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  37.36 
 
 		 329 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  37.37 
 
 		 346 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  33.7 
 
 		 372 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  34.07 
 
 		 333 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  33.67 
 
 		 405 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 337 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 347 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 347 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 347 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 348 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  34.07 
 
 		 333 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  29.9 
 
 		 441 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  35.16 
 
 		 333 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  32.61 
 
 		 404 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  35.16 
 
 		 353 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  31.58 
 
 		 344 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 405 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  35.16 
 
 		 339 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  31.58 
 
 		 344 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 516 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  32.61 
 
 		 572 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  32.97 
 
 		 347 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  34.07 
 
 		 351 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  32.61 
 
 		 401 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  32.97 
 
 		 328 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  30.43 
 
 		 362 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  29.47 
 
 		 413 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  35.16 
 
 		 348 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 557 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 493 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 373 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 506 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 557 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 557 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  32.61 
 
 		 378 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 331 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 412 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 412 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 366 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  35.16 
 
 		 361 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 548 aa  43.5  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  33.67 
 
 		 365 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  33.7 
 
 		 365 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 384 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  32.97 
 
 		 340 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  31.87 
 
 		 328 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  34.31 
 
 		 365 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  30.53 
 
 		 392 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 449 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  29.79 
 
 		 425 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 556 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 362 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0488  transcription elongation factor NusA  30.61 
 
 		 502 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.573333  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 475 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>