More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0485 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 362 aa  722    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  99.72 
 
 		 362 aa  720    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  98.9 
 
 		 362 aa  714    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  75.97 
 
 		 363 aa  549  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  70.14 
 
 		 367 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  69.32 
 
 		 366 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  64.05 
 
 		 374 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  62.57 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  58.97 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  53.95 
 
 		 380 aa  368  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  40.31 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  38.71 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  38.05 
 
 		 414 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  36.36 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  39.18 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  38.44 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  37.54 
 
 		 410 aa  195  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  34.51 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  34.32 
 
 		 421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0652  transcription elongation factor NusA  38.64 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.020983  normal  0.100842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  37.69 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  36.99 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  36.07 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  36.01 
 
 		 520 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  33.71 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  35.4 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  30.38 
 
 		 449 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  33.63 
 
 		 506 aa  179  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  31.1 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  34.93 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  34.93 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 449 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  29.78 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  31.41 
 
 		 503 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  31.41 
 
 		 503 aa  176  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  34.59 
 
 		 534 aa  175  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  29.85 
 
 		 501 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  34.03 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3075  NusA antitermination factor  33.53 
 
 		 497 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  34.23 
 
 		 535 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.48 
 
 		 536 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  32.33 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  34.51 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  34.03 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  34.23 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  35.96 
 
 		 404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  34.03 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  34.33 
 
 		 538 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  34.63 
 
 		 535 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  35.42 
 
 		 572 aa  172  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  34.99 
 
 		 537 aa  172  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  32.74 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  34.58 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  33.79 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  31.3 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  34.29 
 
 		 503 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  34.52 
 
 		 533 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  34.52 
 
 		 552 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  34.3 
 
 		 377 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  29.31 
 
 		 428 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  31.1 
 
 		 499 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  30.46 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  33.13 
 
 		 532 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 568 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3390  transcription elongation factor NusA  31.69 
 
 		 499 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181989  hitchhiker  0.00101946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  34.32 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0960  transcription elongation factor NusA  30.92 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  31.55 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  29.75 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  31.77 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  30.75 
 
 		 495 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  30.98 
 
 		 463 aa  166  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  32.74 
 
 		 544 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  32.53 
 
 		 495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 517 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  28.45 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  33.24 
 
 		 492 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  32.57 
 
 		 537 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  33.93 
 
 		 538 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  32.54 
 
 		 537 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  33.23 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  33.23 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  33.23 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  33.23 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  33.23 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  33.23 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  33.23 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  31.85 
 
 		 560 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1025  transcription elongation factor NusA  31.07 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00167997  hitchhiker  0.00000356504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1090  transcription elongation factor NusA  31.07 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136267  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  31.98 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  33.13 
 
 		 523 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1029  transcription elongation factor NusA  30.79 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0307152  hitchhiker  0.0000658902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0368  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00190694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>