More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1665 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  100 
 
 		 365 aa  731    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  69.08 
 
 		 381 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  68.98 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  70.95 
 
 		 359 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  66.38 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  64.33 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  65.99 
 
 		 373 aa  471  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  64.16 
 
 		 383 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  62.79 
 
 		 346 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  63.07 
 
 		 382 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  59.55 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  59.37 
 
 		 378 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  61.52 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  59.25 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  61.56 
 
 		 380 aa  431  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  58.96 
 
 		 368 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  58.96 
 
 		 368 aa  431  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  58.67 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  60.93 
 
 		 377 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  57.06 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  57.06 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  55.87 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  53.51 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  54.23 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  54.36 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  52.23 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  54.76 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  54.81 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  54.81 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  51.75 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  51.55 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  53.18 
 
 		 442 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  51.75 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  51.83 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  54.05 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  52.46 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  53.06 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  53.22 
 
 		 487 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  54.05 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  53.69 
 
 		 344 aa  360  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  54.55 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  50.15 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  52.8 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  53.1 
 
 		 344 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  51.27 
 
 		 401 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  50.13 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  53.01 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  49.57 
 
 		 537 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  49.57 
 
 		 537 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  49.43 
 
 		 535 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  52 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  46.37 
 
 		 433 aa  346  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  49.57 
 
 		 531 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  47.94 
 
 		 475 aa  342  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  49.71 
 
 		 537 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  50.72 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  49.71 
 
 		 541 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  50 
 
 		 537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  50.73 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  51.59 
 
 		 329 aa  339  5e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  49.71 
 
 		 539 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  48.56 
 
 		 552 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  49.14 
 
 		 538 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  47.66 
 
 		 440 aa  338  9e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  50.73 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  48.84 
 
 		 540 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  48.56 
 
 		 532 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  48.56 
 
 		 533 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  47.13 
 
 		 537 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  48.29 
 
 		 536 aa  335  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  47.41 
 
 		 534 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 		 538 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 		 441 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  50.87 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  47.41 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  48.26 
 
 		 536 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  48.26 
 
 		 538 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  50.56 
 
 		 346 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  47.85 
 
 		 572 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  48.28 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  47.41 
 
 		 506 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  48.5 
 
 		 503 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  47.99 
 
 		 544 aa  328  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  48.68 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  46.55 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  50.73 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  51.46 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  47.47 
 
 		 393 aa  325  7e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  50 
 
 		 506 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  46.7 
 
 		 545 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  46.7 
 
 		 545 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  48.96 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>