More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2431 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  85.75 
 
 		 443 aa  736    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  83.05 
 
 		 429 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  79.9 
 
 		 449 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 428 aa  847    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  70.7 
 
 		 440 aa  594  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  68.13 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  47.47 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  53.74 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  53.74 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  52.15 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  53.58 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  52.44 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  46.21 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  52 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  43.63 
 
 		 531 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  44.58 
 
 		 538 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  44.05 
 
 		 532 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 541 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  52.15 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  44.53 
 
 		 540 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  44.15 
 
 		 537 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 		 536 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  44.53 
 
 		 539 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  49.18 
 
 		 385 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  43.55 
 
 		 538 aa  347  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  42.52 
 
 		 536 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  43.54 
 
 		 537 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.78 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  42.62 
 
 		 544 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.38 
 
 		 535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  43.14 
 
 		 537 aa  339  7e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  43.14 
 
 		 537 aa  339  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  40.84 
 
 		 556 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  44.23 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  42.99 
 
 		 560 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  43.03 
 
 		 545 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  43.03 
 
 		 545 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  43.64 
 
 		 552 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  42.12 
 
 		 538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  40.84 
 
 		 557 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  40.84 
 
 		 557 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  43.5 
 
 		 537 aa  336  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  40.6 
 
 		 557 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  42.51 
 
 		 545 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  43.49 
 
 		 506 aa  332  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  43.39 
 
 		 535 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  42.79 
 
 		 534 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  43.14 
 
 		 533 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  43.86 
 
 		 523 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 538 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  42.54 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  42.54 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  41.32 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  43.83 
 
 		 506 aa  325  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  46 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  42.89 
 
 		 544 aa  322  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  46.02 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  42.3 
 
 		 572 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  46.7 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  46.24 
 
 		 346 aa  312  9e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  44.51 
 
 		 493 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  46.29 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  41.42 
 
 		 548 aa  309  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  40.38 
 
 		 544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  40.52 
 
 		 559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  45.22 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  45.56 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  46.67 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  44.22 
 
 		 384 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  46.67 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  39.95 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  42.68 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  42.68 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  40.57 
 
 		 534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  39.61 
 
 		 538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  43.06 
 
 		 381 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  44 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  40.29 
 
 		 493 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  43.93 
 
 		 373 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  40.76 
 
 		 495 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  37.32 
 
 		 491 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  37.32 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  42.69 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  41.57 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  45.53 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  42.98 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  42.16 
 
 		 529 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  37.32 
 
 		 491 aa  292  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  38.8 
 
 		 506 aa  292  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  37.2 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>