More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0508 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 366 aa  729    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  60 
 
 		 366 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  61.35 
 
 		 367 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  58.7 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  58.97 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  58.97 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  61.04 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  58.97 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  56.65 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  51.45 
 
 		 380 aa  359  3e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  36.31 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  33.16 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 444 aa  192  7e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  34.37 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  36.26 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 503 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  33.88 
 
 		 506 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  36.51 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  35.6 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.02 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  35.67 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  35.51 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  32.36 
 
 		 493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  37.72 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  34.12 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1026  NusA antitermination factor  31.75 
 
 		 496 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.152945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  33.53 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  32.03 
 
 		 498 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  34.63 
 
 		 490 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  35.19 
 
 		 417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 382 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  32.03 
 
 		 501 aa  179  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  33.52 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3075  NusA antitermination factor  31.67 
 
 		 497 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  33.03 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  35.24 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  34.72 
 
 		 491 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  35.21 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  31.96 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2821  transcription elongation factor NusA  31.51 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  31.96 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  31.96 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  34.02 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  31.48 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  31.59 
 
 		 503 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  31.59 
 
 		 503 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  34.17 
 
 		 491 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  34.44 
 
 		 491 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  30.92 
 
 		 495 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2690  transcription elongation factor NusA  31.23 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  31.61 
 
 		 463 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  30.19 
 
 		 493 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 491 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  30.19 
 
 		 493 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  31.13 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  31.13 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  33.9 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  33.52 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  32.51 
 
 		 495 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  31.39 
 
 		 495 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  31.39 
 
 		 499 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  29.7 
 
 		 493 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2816  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 503 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 491 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 491 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 491 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  32.7 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  33.52 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  32.34 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 493 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  32.95 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  30.36 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  32.96 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  36.98 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  34.65 
 
 		 560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0778  transcription elongation factor NusA  29.95 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311397  normal  0.0634223 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  32.69 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  32.69 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  31.68 
 
 		 532 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  33.05 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  30.36 
 
 		 498 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  31.3 
 
 		 537 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  34.42 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>