More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0427 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  100 
 
 		 374 aa  749    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  68.9 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  67.47 
 
 		 367 aa  489  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  64.05 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  64.05 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  63.61 
 
 		 362 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  64.8 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  60.16 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  56.2 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  56.65 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  38.04 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  35.4 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  34.03 
 
 		 421 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  34.42 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  38.38 
 
 		 392 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  35.58 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  36.65 
 
 		 414 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  40.75 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  34.9 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  34.49 
 
 		 410 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  36.5 
 
 		 360 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  33.6 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0652  transcription elongation factor NusA  38.19 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.020983  normal  0.100842 
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  35.19 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  36.94 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  33.91 
 
 		 537 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  33.91 
 
 		 537 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  35.09 
 
 		 538 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  33.91 
 
 		 534 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  31.02 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 545 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  33.63 
 
 		 535 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 544 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  34.49 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  33.04 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  33.04 
 
 		 545 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  35.48 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  35.31 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.21 
 
 		 536 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  33.04 
 
 		 532 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  30.95 
 
 		 449 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  32.75 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  33.92 
 
 		 572 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  32.84 
 
 		 428 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  33.51 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  35.57 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  32.46 
 
 		 560 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  32.94 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 523 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 540 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  32.85 
 
 		 541 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  32.75 
 
 		 535 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 534 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  31.51 
 
 		 463 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  32.75 
 
 		 535 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  33.92 
 
 		 552 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  34.18 
 
 		 490 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  36.89 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 538 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 539 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  32.75 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  32.85 
 
 		 537 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 533 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  31.48 
 
 		 501 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  32.26 
 
 		 491 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  31.87 
 
 		 380 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  32.74 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  32.96 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  33.43 
 
 		 536 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 568 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  32.06 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  31.32 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  32.27 
 
 		 537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  33.83 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  32.96 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  32.16 
 
 		 531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  30.73 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  32.85 
 
 		 538 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 491 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 491 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  32.36 
 
 		 491 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  33.04 
 
 		 493 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  31.68 
 
 		 556 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  30.85 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  30.85 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  35.27 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  30.85 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>