More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0324 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 363 aa  722    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  75.97 
 
 		 362 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  75.97 
 
 		 362 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  75.97 
 
 		 362 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  69.21 
 
 		 367 aa  503  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  68.58 
 
 		 366 aa  499  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  64.8 
 
 		 374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  63.11 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  61.04 
 
 		 366 aa  414  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  52.77 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  39.18 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  38.85 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  37.74 
 
 		 411 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  37.93 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  37.84 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  38.19 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  32.32 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  38.14 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  38.2 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  36.08 
 
 		 410 aa  185  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  37.17 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  36.84 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  35.19 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 520 aa  180  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0652  transcription elongation factor NusA  37.38 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.020983  normal  0.100842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 568 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  36.72 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  36.94 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  33.97 
 
 		 506 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 444 aa  176  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  34.15 
 
 		 498 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  34.02 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  33.79 
 
 		 503 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  31.34 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  30.41 
 
 		 501 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  30.75 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  31.96 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  33.52 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  32.39 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  32.74 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  34.01 
 
 		 517 aa  170  4e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  32.8 
 
 		 517 aa  170  4e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  33.78 
 
 		 501 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  33.61 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  32.29 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  32.78 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0068  transcription elongation factor NusA  32.17 
 
 		 494 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.272639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  30.65 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  33.06 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  32.78 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  33.53 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  32.78 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  31.9 
 
 		 494 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  32.87 
 
 		 536 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 531 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  32.2 
 
 		 449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  32.31 
 
 		 534 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  31.48 
 
 		 538 aa  166  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  31.96 
 
 		 506 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  31.2 
 
 		 495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  33.06 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  32.05 
 
 		 537 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0156  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 495 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  32.74 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  31.75 
 
 		 538 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3075  NusA antitermination factor  30.75 
 
 		 497 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  30.06 
 
 		 443 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  33.06 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  31.39 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  32.24 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  31.04 
 
 		 541 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  31.96 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  30.49 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  32.24 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 497 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  32.22 
 
 		 503 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  31.94 
 
 		 491 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  31.32 
 
 		 536 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  30.36 
 
 		 503 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  30.41 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  30.36 
 
 		 503 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  31.94 
 
 		 491 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  31.67 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>