More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0735 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 344 aa  667    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  71.68 
 
 		 344 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  68.73 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  67.55 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  55.39 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  47.06 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  50.59 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  49.27 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  47.65 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  49.41 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  47.94 
 
 		 383 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  47.06 
 
 		 381 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  47.46 
 
 		 493 aa  292  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  49.55 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  48.31 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  45.29 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  44.68 
 
 		 449 aa  277  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  46.45 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  43.2 
 
 		 442 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  43.62 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  42.03 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  44.31 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  44.31 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  42.6 
 
 		 442 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  44.61 
 
 		 369 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  43.88 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  44.91 
 
 		 381 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  42.6 
 
 		 534 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.2 
 
 		 535 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  43.2 
 
 		 537 aa  269  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  43.2 
 
 		 537 aa  269  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  43.11 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  43.2 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  44.17 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  45.7 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  41.12 
 
 		 536 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  42.06 
 
 		 423 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  45.32 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  43.36 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  43.2 
 
 		 385 aa  262  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  41.72 
 
 		 538 aa  262  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  43.36 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  41.72 
 
 		 533 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  42.65 
 
 		 442 aa  261  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  42.31 
 
 		 532 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  41.42 
 
 		 535 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  46.47 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  41.69 
 
 		 475 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  41.42 
 
 		 552 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  46.18 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  44.25 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 		 537 aa  259  4e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  39.94 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  41.42 
 
 		 538 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  41.18 
 
 		 506 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  41.57 
 
 		 421 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  41.76 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  43.41 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  41.07 
 
 		 506 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  41.96 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  41.27 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  41.72 
 
 		 544 aa  252  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  41.32 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  41.12 
 
 		 545 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  41.12 
 
 		 545 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  41.18 
 
 		 537 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  41.59 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  40.36 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  42.06 
 
 		 531 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  39.82 
 
 		 444 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  40.83 
 
 		 560 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  40.83 
 
 		 536 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  42.61 
 
 		 495 aa  249  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  45.48 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  41.72 
 
 		 541 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  40.88 
 
 		 540 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  40.29 
 
 		 538 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  46.29 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  40.29 
 
 		 536 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  41.07 
 
 		 537 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  39.94 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  39.94 
 
 		 545 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  39.34 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  38.11 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  40.29 
 
 		 539 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  40.42 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  38.42 
 
 		 492 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>