More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2412 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 441 aa  884    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  67.7 
 
 		 443 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  69.17 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  68.28 
 
 		 440 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  68.13 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  66.03 
 
 		 449 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  47.65 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  51.54 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  51.54 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  51.03 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  42.18 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  52.06 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  51.32 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.5 
 
 		 536 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  43.24 
 
 		 538 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  49.28 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  44.23 
 
 		 541 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  43.84 
 
 		 537 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  44.5 
 
 		 544 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  43.73 
 
 		 539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  44.36 
 
 		 537 aa  353  4e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  44 
 
 		 536 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  43.14 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  42.61 
 
 		 531 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  43.73 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  43 
 
 		 532 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  50.73 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.56 
 
 		 535 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  43.32 
 
 		 537 aa  349  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  43.32 
 
 		 537 aa  349  5e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  43 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  43.36 
 
 		 534 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  44.36 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  43.61 
 
 		 560 aa  343  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  50.45 
 
 		 385 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  42.75 
 
 		 545 aa  342  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  42.75 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  43.61 
 
 		 552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  43.11 
 
 		 533 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  43.46 
 
 		 506 aa  335  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  45.24 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  42.82 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  42.93 
 
 		 506 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  43.31 
 
 		 557 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  43.31 
 
 		 557 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 538 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  43.04 
 
 		 556 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  43.31 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  40.32 
 
 		 503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  40 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  40.09 
 
 		 503 aa  327  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.36 
 
 		 572 aa  326  5e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  38.53 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  42.54 
 
 		 523 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  46.29 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  44.9 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  43.97 
 
 		 544 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  44.67 
 
 		 384 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  43.05 
 
 		 383 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  40.75 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  40.75 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  45.7 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  39.27 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  40.05 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  39.02 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  44.09 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  39.95 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  39.95 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  37.22 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  38.5 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  42.39 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  44.81 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  39.47 
 
 		 492 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  38.69 
 
 		 491 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  40.43 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  39.95 
 
 		 538 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  46.67 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002608  transcription termination protein NusA  38.91 
 
 		 495 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000346209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  38.59 
 
 		 491 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  43.7 
 
 		 529 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  37.29 
 
 		 506 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  45.1 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  40.05 
 
 		 544 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  39.76 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03397  transcription elongation factor NusA  38.46 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  40.28 
 
 		 559 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  38.48 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  38.46 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01302  transcription elongation factor NusA  38.31 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.30262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  42.54 
 
 		 359 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  45.56 
 
 		 346 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  40.45 
 
 		 538 aa  308  9e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  40.49 
 
 		 506 aa  308  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0816  NusA antitermination factor  38.29 
 
 		 499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.706967  hitchhiker  0.00205757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  44.19 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  44.81 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  38.06 
 
 		 499 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2425  NusA antitermination factor  40.24 
 
 		 506 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000562867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>