More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1748 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 380 aa  761    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  56.2 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  56.46 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  54.88 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  54.88 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  53.95 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  55.84 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  53.95 
 
 		 362 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  52.77 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  51.45 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  36.49 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.01 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  34.76 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  37.58 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  34.71 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  35.18 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  34.94 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  32.13 
 
 		 538 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  33.06 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 557 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  33.42 
 
 		 503 aa  182  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0652  transcription elongation factor NusA  34 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.020983  normal  0.100842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  33.42 
 
 		 556 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  35.11 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  35.11 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  36.42 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  34.96 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  32 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  34.46 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  33.15 
 
 		 475 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  31.27 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  32.23 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  34.29 
 
 		 449 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  32.34 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  34.92 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  32.28 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  31.74 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  34.38 
 
 		 534 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  35.88 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  31.87 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  32.08 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  32.44 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  32.76 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  34.1 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  33.05 
 
 		 536 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  32.66 
 
 		 552 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  34.1 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  33.05 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  31.23 
 
 		 493 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  31.32 
 
 		 493 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  32.38 
 
 		 533 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  31.5 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 535 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  32.07 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  33.05 
 
 		 544 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  32.47 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  34.1 
 
 		 346 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 493 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0778  transcription elongation factor NusA  30.96 
 
 		 493 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311397  normal  0.0634223 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 537 aa  166  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  32.95 
 
 		 544 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  33.62 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  32.08 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  32.37 
 
 		 532 aa  165  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  33.43 
 
 		 536 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  29.32 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  32.38 
 
 		 534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  30.58 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  30.58 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  32.07 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  32.66 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  30.58 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  31.03 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  32.66 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  33.24 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  32.51 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  31.61 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  32.66 
 
 		 536 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  32.32 
 
 		 503 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  32.66 
 
 		 541 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  30.75 
 
 		 473 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  31.99 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2813  NusA antitermination factor  32.09 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607539  hitchhiker  0.00248823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  31.27 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 537 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  32.02 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 531 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  32.07 
 
 		 559 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  30.79 
 
 		 538 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  31.55 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>