More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0572 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  100 
 
 		 371 aa  714    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  45.53 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  46.09 
 
 		 381 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  44.97 
 
 		 382 aa  298  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  44.97 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  43.01 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  44.69 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 449 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  43.18 
 
 		 404 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  45.05 
 
 		 377 aa  288  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.72 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  43.72 
 
 		 537 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  43.99 
 
 		 538 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  43.72 
 
 		 537 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  42.62 
 
 		 534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  43.44 
 
 		 552 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  43.17 
 
 		 535 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  43.17 
 
 		 533 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  43.02 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  43.7 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.06 
 
 		 537 aa  280  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  41.37 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  39.23 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  42.9 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  42.25 
 
 		 475 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  43.73 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  43.38 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  40.55 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  40.82 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  43.17 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  43.44 
 
 		 545 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  43.17 
 
 		 536 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  43.44 
 
 		 545 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  40.27 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  40.55 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  40.67 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  43.17 
 
 		 544 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  40.33 
 
 		 506 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  43.17 
 
 		 560 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  41.58 
 
 		 538 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  42.08 
 
 		 538 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  42.74 
 
 		 463 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  42.51 
 
 		 541 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  41.96 
 
 		 540 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  41.78 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  41.64 
 
 		 536 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  42.08 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 537 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  41.01 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  42.23 
 
 		 539 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  42.62 
 
 		 545 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  41.96 
 
 		 537 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  40.44 
 
 		 382 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  39.44 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  37.87 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  43.68 
 
 		 516 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  38.95 
 
 		 429 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  39.61 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  40.92 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  41.26 
 
 		 572 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  38.95 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  40.66 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  39.89 
 
 		 536 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  42.45 
 
 		 506 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  40.16 
 
 		 538 aa  262  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  39.03 
 
 		 557 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  39.03 
 
 		 557 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  39.03 
 
 		 557 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  41.18 
 
 		 544 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  38.8 
 
 		 428 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  37.29 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  38.27 
 
 		 556 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  40.67 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  36.73 
 
 		 492 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  38.96 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  40.87 
 
 		 568 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  37.64 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  40.27 
 
 		 534 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  38.44 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  37.64 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  37.67 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  41.1 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  39.34 
 
 		 491 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  40.67 
 
 		 529 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  40.98 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3466  transcription elongation factor NusA  37.91 
 
 		 496 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  38.01 
 
 		 493 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  37.4 
 
 		 491 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  41.64 
 
 		 534 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  39.34 
 
 		 491 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  39.06 
 
 		 491 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  39.34 
 
 		 491 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>