More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3779 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  73.43 
 
 		 523 aa  672    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  62.73 
 
 		 545 aa  650    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  67.05 
 
 		 536 aa  675    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  68.51 
 
 		 533 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  73.95 
 
 		 506 aa  704    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  68.58 
 
 		 537 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  67.87 
 
 		 538 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  64.97 
 
 		 531 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  67.87 
 
 		 538 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  63.99 
 
 		 536 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  64.5 
 
 		 532 aa  641    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  67.66 
 
 		 552 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  68.51 
 
 		 535 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 516 aa  1023    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  68.58 
 
 		 537 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  62.8 
 
 		 545 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  64.65 
 
 		 545 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  63.21 
 
 		 544 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  67.87 
 
 		 535 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  63.93 
 
 		 560 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  62.28 
 
 		 537 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  60.11 
 
 		 537 aa  630  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  65.96 
 
 		 534 aa  628  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  62.28 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  61.9 
 
 		 541 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  61.16 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  64.02 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  61.9 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  61.05 
 
 		 538 aa  615  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  60.72 
 
 		 536 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  59.09 
 
 		 544 aa  595  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  62.2 
 
 		 568 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  58.58 
 
 		 548 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  61.52 
 
 		 529 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  62.8 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  64.52 
 
 		 544 aa  567  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  63.01 
 
 		 534 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  62.8 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  60.86 
 
 		 538 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  56.26 
 
 		 559 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  56.98 
 
 		 590 aa  531  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  57.26 
 
 		 506 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  50.51 
 
 		 493 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  50.51 
 
 		 493 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  48.08 
 
 		 492 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  46.87 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  47.27 
 
 		 491 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  47.58 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  46.87 
 
 		 491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  46.67 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2425  NusA antitermination factor  47.24 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000562867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  48.99 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  48.8 
 
 		 498 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  49.21 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  48.18 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  49.6 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  48.18 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  49.29 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  47.98 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  49.49 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  49.29 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  46.26 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  49.09 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  47.57 
 
 		 492 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  46.87 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  49.09 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  47.98 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  49.09 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  49.09 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3384  NusA antitermination factor  47.77 
 
 		 494 aa  438  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0163394  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  46.99 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  46.34 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  47.77 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  47.77 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03397  transcription elongation factor NusA  46.87 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  47.77 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  46.57 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  47.57 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2747  NusA antitermination factor  47.47 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  47.77 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  47.77 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  47.37 
 
 		 506 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  47.77 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  47.25 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  47.77 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  45.95 
 
 		 498 aa  432  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  46.99 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  46.64 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2133  NusA antitermination factor  47.37 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.502906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1700  NusA antitermination factor  47.79 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  42.13 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  47.37 
 
 		 493 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002608  transcription termination protein NusA  46.26 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000346209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  45.34 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  45.34 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2989  NusA antitermination factor  47.48 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  47.37 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  46.26 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>