More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3679 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  100 
 
 		 493 aa  993    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  70.76 
 
 		 384 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  69.68 
 
 		 362 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  64.21 
 
 		 381 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  59.28 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  67.25 
 
 		 359 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  66.18 
 
 		 382 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  64.33 
 
 		 365 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  65.14 
 
 		 383 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  64.91 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  64.51 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  64.55 
 
 		 382 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  62.82 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  64.43 
 
 		 366 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  62.25 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  62.54 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  58.65 
 
 		 373 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  65.2 
 
 		 377 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  58.19 
 
 		 378 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  59.18 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  59.37 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  59.65 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  56.2 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  56.2 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  56.2 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  54.94 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  52.34 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  52.34 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  52.34 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  47.62 
 
 		 381 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  51.8 
 
 		 382 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  51.8 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  47.93 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 		 383 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  49.43 
 
 		 433 aa  352  8e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  50.14 
 
 		 442 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  49.28 
 
 		 442 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  50.44 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  51.16 
 
 		 442 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  51.15 
 
 		 444 aa  346  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  51.75 
 
 		 369 aa  343  4e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  52.46 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  50.94 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  51.92 
 
 		 372 aa  340  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  50 
 
 		 385 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  50.43 
 
 		 348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  47.66 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  49.26 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  47.41 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  50.15 
 
 		 344 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  50.44 
 
 		 324 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  50.58 
 
 		 329 aa  333  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  50.15 
 
 		 344 aa  332  9e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  50.15 
 
 		 365 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  49.86 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  46.85 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  50.15 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  47.37 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  42.25 
 
 		 536 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  49.57 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  49.56 
 
 		 361 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  46.78 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  49 
 
 		 337 aa  324  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 541 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  45.61 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  50.44 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  49.85 
 
 		 354 aa  324  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  47.63 
 
 		 535 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  49.57 
 
 		 347 aa  323  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  47.28 
 
 		 347 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  47.63 
 
 		 537 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  47.63 
 
 		 537 aa  323  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  50.29 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  45.45 
 
 		 545 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  47.37 
 
 		 537 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  45.45 
 
 		 545 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  46.47 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  45.88 
 
 		 538 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  45.29 
 
 		 560 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  50.6 
 
 		 327 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  46.2 
 
 		 540 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  47.38 
 
 		 381 aa  320  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  45.16 
 
 		 545 aa  319  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  48.83 
 
 		 344 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  46.78 
 
 		 539 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  48.86 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  46.15 
 
 		 572 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  49.13 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  49.26 
 
 		 331 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  46.49 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  48.39 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  46.2 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>