More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0262 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 366 aa  725    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  88.25 
 
 		 367 aa  649    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  69.21 
 
 		 365 aa  501  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  68.9 
 
 		 374 aa  498  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0324  transcription elongation factor NusA  68.58 
 
 		 363 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0510  transcription elongation factor NusA  69.32 
 
 		 362 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0485  transcription elongation factor NusA  69.32 
 
 		 362 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1479  transcription elongation factor NusA  69.04 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  60 
 
 		 366 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  56.46 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  40.06 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  36.8 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1262  transcription elongation factor NusA  38.17 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  37.42 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  37.69 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  37.58 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  40.31 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  37.54 
 
 		 344 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01340  transcription elongation factor NusA  36.96 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  38.55 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  38.01 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  38.06 
 
 		 517 aa  189  7e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  40.37 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.31 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  35.81 
 
 		 503 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  37.1 
 
 		 517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  35.54 
 
 		 503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0652  transcription elongation factor NusA  39.13 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.020983  normal  0.100842 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  33.51 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  33.52 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  33.53 
 
 		 428 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  37.36 
 
 		 393 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  36.5 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  37.43 
 
 		 520 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  33.43 
 
 		 495 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  35.21 
 
 		 541 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  34.36 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  35.52 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  35.83 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  34.4 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  34.39 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  34.37 
 
 		 539 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  32.41 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  33.98 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  34.42 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  34.65 
 
 		 540 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  32.2 
 
 		 495 aa  176  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  35.93 
 
 		 534 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  34.2 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1463  transcription elongation factor NusA  38.63 
 
 		 527 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0965243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  34.72 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  34.53 
 
 		 491 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  33.42 
 
 		 503 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  33.93 
 
 		 532 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  35.33 
 
 		 535 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  35.33 
 
 		 535 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  34.02 
 
 		 506 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  34.42 
 
 		 516 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  34.6 
 
 		 534 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  34.31 
 
 		 537 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  34.31 
 
 		 537 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  35.47 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  35.8 
 
 		 493 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  33.8 
 
 		 503 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  33.24 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  35.36 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  35.31 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 537 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0397  transcription elongation factor NusA  37.5 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  34.72 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 499 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  33.24 
 
 		 537 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  34.6 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  32.25 
 
 		 475 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 535 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  34.08 
 
 		 536 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  32.27 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  32.44 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.12 
 
 		 536 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  36.18 
 
 		 523 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  34.63 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  32.15 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  33.82 
 
 		 537 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  36.09 
 
 		 568 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  32.45 
 
 		 441 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  33.63 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  33.8 
 
 		 491 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1026  NusA antitermination factor  33.15 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.152945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  35.54 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>