More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2068 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  64.23 
 
 
537 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  66.53 
 
 
538 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  62.91 
 
 
532 aa  634    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  62.08 
 
 
538 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  66.28 
 
 
536 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  68.22 
 
 
535 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  71.98 
 
 
516 aa  697    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  64.23 
 
 
537 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  67.37 
 
 
535 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
523 aa  1031    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  67.16 
 
 
552 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  67.8 
 
 
533 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  84.72 
 
 
506 aa  821    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  62.2 
 
 
537 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  62.89 
 
 
531 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  66.31 
 
 
534 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  60.52 
 
 
560 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  60.04 
 
 
545 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  65.74 
 
 
536 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  64.19 
 
 
537 aa  619  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  62.21 
 
 
537 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  60.64 
 
 
545 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  62.52 
 
 
539 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  65.89 
 
 
541 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  61.45 
 
 
540 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  61.7 
 
 
544 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  61.52 
 
 
545 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  61.72 
 
 
536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  64.12 
 
 
538 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  60.04 
 
 
544 aa  595  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  60.97 
 
 
572 aa  585  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  59.37 
 
 
548 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  59.17 
 
 
534 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  58.97 
 
 
535 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  61.76 
 
 
529 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  58.97 
 
 
535 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  61.78 
 
 
544 aa  557  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  56.7 
 
 
538 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  62.42 
 
 
568 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  59.96 
 
 
559 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  53.58 
 
 
590 aa  525  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  54.6 
 
 
506 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  50.41 
 
 
493 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  50.41 
 
 
493 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  49.49 
 
 
498 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  50.1 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  48.58 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  47.27 
 
 
495 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  47.78 
 
 
491 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  48.5 
 
 
499 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  47.45 
 
 
492 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  43.7 
 
 
517 aa  429  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  48.68 
 
 
491 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  48.07 
 
 
495 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  46.95 
 
 
491 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  48.07 
 
 
491 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  44.49 
 
 
517 aa  421  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  47.89 
 
 
493 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  48.58 
 
 
491 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  48.07 
 
 
491 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  48.68 
 
 
491 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  48.68 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  48.68 
 
 
491 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  48.31 
 
 
501 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  48.07 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  48.48 
 
 
491 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 
503 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  47.15 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  46.65 
 
 
493 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  45.98 
 
 
498 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  48.28 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  46.75 
 
 
491 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  46.29 
 
 
499 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  46.14 
 
 
503 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 
491 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3390  transcription elongation factor NusA  46.09 
 
 
499 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181989  hitchhiker  0.00101946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  45.05 
 
 
495 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  45.64 
 
 
493 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  45.64 
 
 
493 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3466  transcription elongation factor NusA  46.25 
 
 
496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  46.34 
 
 
492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  45.69 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  46.04 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1006  transcription elongation factor NusA  45.69 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.614883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  44.87 
 
 
497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  46.17 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0989  transcription elongation factor NusA  45.69 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0722775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  45.58 
 
 
497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03397  transcription elongation factor NusA  45.66 
 
 
495 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  45.97 
 
 
494 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>