More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0811 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 423 aa  842    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  61.67 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  57.73 
 
 		 368 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  54.28 
 
 		 383 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  53.39 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  56.13 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  54.5 
 
 		 395 aa  395  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  49.35 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  50 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  50.67 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  54.94 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  52.33 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  54.34 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  52.03 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  52.46 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  54.36 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  51.59 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  54.36 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  55.17 
 
 		 473 aa  368  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  52.17 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  51.56 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  50.96 
 
 		 362 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  50.39 
 
 		 377 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  52.89 
 
 		 354 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  51.26 
 
 		 359 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  53.2 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  52.92 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  50.13 
 
 		 382 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  50.3 
 
 		 380 aa  332  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  47.86 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  45.8 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  47.13 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  45.55 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  46.84 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  47.71 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  46.42 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  46.63 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  42.93 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  46.51 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  44.65 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  44.57 
 
 		 506 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  46.33 
 
 		 344 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  47.59 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  47.59 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  46.51 
 
 		 487 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  46.08 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  46.67 
 
 		 385 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  43.85 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  46.45 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  44.41 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  44.28 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  46.97 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  44.57 
 
 		 348 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  44.41 
 
 		 503 aa  289  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  44.31 
 
 		 369 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  43.93 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  44.78 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  44.73 
 
 		 354 aa  285  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  44.57 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.99 
 
 		 572 aa  285  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  42.15 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  45.69 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  43.55 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  44.15 
 
 		 537 aa  281  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  42.18 
 
 		 441 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  43.57 
 
 		 328 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 331 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  43.33 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  43.31 
 
 		 538 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  43.6 
 
 		 536 aa  279  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  42.82 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  43.7 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  42.25 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  42.73 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  43.79 
 
 		 324 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  40.61 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  43.9 
 
 		 531 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  43.15 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  43.9 
 
 		 534 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  44.44 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  43.36 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  42.57 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  42.65 
 
 		 346 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  42.77 
 
 		 540 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  44.44 
 
 		 537 aa  272  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  43.06 
 
 		 541 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  44.44 
 
 		 537 aa  272  8.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  41.94 
 
 		 538 aa  272  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  42.44 
 
 		 545 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  42.44 
 
 		 545 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>