More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0696 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  100 
 
 		 395 aa  800    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  56.6 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  54.5 
 
 		 423 aa  395  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  53.25 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  54.2 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  53.26 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  53.26 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  51.01 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  52.99 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  52.99 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  52.99 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  52.99 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  52.99 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  52.99 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  52.99 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  52.72 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  52.45 
 
 		 368 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  50.38 
 
 		 373 aa  355  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  50.13 
 
 		 365 aa  352  7e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  51.88 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  50 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  49.87 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  50.94 
 
 		 493 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  49.46 
 
 		 391 aa  338  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  49.46 
 
 		 391 aa  338  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  49.06 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  49.33 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  51.61 
 
 		 382 aa  335  9e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  50.39 
 
 		 377 aa  334  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  48.22 
 
 		 378 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  49.86 
 
 		 346 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  48.44 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  49.46 
 
 		 380 aa  329  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  49.32 
 
 		 354 aa  329  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  47.58 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  42.89 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  44.68 
 
 		 366 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  44.62 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  45.09 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  42.67 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  44.17 
 
 		 385 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.09 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  45.43 
 
 		 537 aa  290  3e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  43.81 
 
 		 503 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  42.25 
 
 		 557 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  43.6 
 
 		 538 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  42.25 
 
 		 557 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  42.25 
 
 		 557 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  44.09 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  41.3 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  43.97 
 
 		 538 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  43.43 
 
 		 532 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  43.97 
 
 		 534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  44.11 
 
 		 534 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  43.16 
 
 		 535 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  43.24 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  43.67 
 
 		 545 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  43.67 
 
 		 560 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  44.12 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  43.67 
 
 		 545 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  44.12 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  43.01 
 
 		 533 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  44.12 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  43.55 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  43.82 
 
 		 544 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  43.56 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  42.2 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  43.56 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  43.55 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  43.28 
 
 		 536 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  40.53 
 
 		 538 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  43.56 
 
 		 535 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  43.56 
 
 		 535 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  43.28 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  43.56 
 
 		 538 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.61 
 
 		 572 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  43.25 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  42.43 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  42.03 
 
 		 491 aa  276  4e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  44.2 
 
 		 506 aa  276  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  41.67 
 
 		 556 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  44.03 
 
 		 330 aa  275  9e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  43.58 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  42.98 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  43.13 
 
 		 544 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  40.91 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  41.94 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  42.42 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  42.82 
 
 		 487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  41.18 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  41.6 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  44.62 
 
 		 329 aa  273  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  41.69 
 
 		 429 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  42.42 
 
 		 559 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  40.83 
 
 		 475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  43.32 
 
 		 541 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  40.16 
 
 		 495 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  41.84 
 
 		 516 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>